5500个新RNA病毒物种,在海洋发现



文/陈根
新冠病毒让人们对病毒有了更深刻的认识,也引起了科学界对病毒的更多关注。实际上,病毒存活的年限比人类还要古老的多。当地球上诞生第一个细胞时,病毒很可能就已经存在了。
病毒在人们的印象里一直扮演着十恶不赦的形象,正如新冠病毒一样,病毒不仅攻击个人的免疫系统,同时还会造成群体大规模的传染病,威胁人类的生命。对于动物也是如此,在海洋中以及一些我们人类科研还没有深度覆盖的地方可能也存在着群体性的传染病。
尽管病毒让我们听起来并不是那么友善的感受,但事实上,病毒却对我们人类具有不可替代的作用。病毒不仅造就了地球今天这样的环境,维持着生态的平衡,并且默默地改造着地球的环境,病毒的演变更对人类理解物种演变具有重要的帮助。病毒和人类其实是共存的。
近日,通过结合机器学习分析和传统的进化树,一个国际研究小组已经确定了5500个新的RNA病毒物种——其代表了所有五个已知的RNA病毒门类,另外还指出至少需要五个新的RNA病毒门类来捕获它们。
具体来看,通过接受对RNA病毒进行分类的挑战,该小组进入了早期分类工作的水域,这些分类工作主要集中在RNA病毒病原体上,但仍有波澜。在生物王国Orthornavirae中,国际病毒分类委员会(ICTV)最近确认了五个门类。
尽管研究小组确定了数百个新的RNA病毒物种符合这些现有的划分,但他们的分析又确定了数以千计的物种,他们将这些物种归入五个新的拟议门类:Taraviricota、Pomiviricota、Paraxenoviricota、Wamoviricota和Arctiviricota。
其中,最丰富的新识别物种集合属于一个拟议的门类,研究人员将其命名为Taraviricota,这是对能进行分析的35,000份水样的来源的认可:Tara Oceans Consortium(Tara海洋联盟),这是一个正在进行的全球研究,其正在Tara号双桅船上研究气候变化对世界海洋的影响。这项研究的论文第一作者、俄亥俄州立大学微生物学教授Matthew Sullivan指出:“这里有如此多的新多样性——且整个门类即Taraviricota在海洋中都有被发现,这表明它们在生态上非常重要。RNA病毒在我们的世界中显然也非常重要,但我们通常只研究它们中的一小部分——那几百种危害人类、植物和动物的病毒。我们想在一个非常大的范围内系统地研究它们并探索一个没有人深入研究过的环境,我们很幸运,因为几乎每一个物种都是新的且许多是真正的新物种。”
这项研究于2022年4月7日发表在《科学》上。实际上,对病毒的研究也是对人类的提醒,某种程度上,人类已经成为地球的主人或是最重要的统治者,人具有了超越自然的力量,具有了摆脱自然束缚的能力。但世界上依然存在未知的病毒,而这需要人类的探索。

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