肿瘤领域单细胞多组学大盘点之消化系统肿瘤领

作者：王韵壹、李英、熊慧卿

　　截至2022年8月，欧易生物单细胞事业部在肿瘤领域合作的研究硕果累累，助力客户发表31篇肿瘤领域单细胞文章，平均IF达12.62。

　　今天，小编带着大家一起回顾7篇欧易单细胞消化系统肿瘤领域的客户文章吧~

　　基于成像质谱技术的肝癌微环境拓扑分析揭示了不同个体发育的巨噬细胞对细胞邻域的反向调节

　　Topological analysis of hepatocellular carcinoma tumour microenvironment based on imaging mass cytometry reveals cellular neighbourhood regulated reversely by macrophages with different ontogeny

　　发表期刊：

　　Gut

　　影响因子：31.793

　　DOI:10.1136/gutjnl-2021-324339

　　文章概述：肝细胞癌 (HCC) 肿瘤微环境 (TME) 是高度复杂的，具有组织成各种功能单元、细胞邻域 (CN) 的多种细胞成分。该研究结果揭示了肝细胞癌肿瘤微环境的各种拓扑功能单元，也提供了大的肝细胞癌病理景观库。这项工作突出了特异性靶向Kupffer细胞而不是阻断髓样细胞整体作为肝细胞癌治疗的新型免疫疗法的潜力。

　　异源Vδ2 γδ T细胞可作为肝细胞癌浸润γδ T细胞功能缺陷的补充

　　Hepatocellular carcinoma-infiltrating γδ T cells are functionally defected and allogenic Vδ2 γδ T cell can be a promising complement

　　发表期刊：

　　Clinical and Translational Medicine

　　影响因子：8.554

　　DOI:10.1002/ctm2.800

　　材料：HCC患者和健康人肝灌洗液

　　文章概述：该研究通过比较肝细胞癌（HCC）患者和健康人肝灌洗液中的γδ T细胞，发现HCC患者中具有一群独特的γδ T亚群，进一步针对该亚群进行功能富集分析、拟时序分析、细胞周期等分析，发现该亚群LAG3耗竭标记基因以及谷氨酰胺等相关代谢通路显著上调，细胞增殖等相关通路下调，细胞周期停滞在G2/M期。此外，该亚群TCR多样性与克隆型相比健康对照组HCC组明显丢失。研究为未来HCC免疫治疗提供重要的参考。

　　单细胞RNA测序结合多组学解析肝内胆管癌的分子亚群

　　Molecular Subgroups of Intrahepatic Cholangiocarcinoma Discovered by Single-Cell RNA Sequencing–Assisted Multiomics Analysis

　　发表期刊：

　　Cancer Immunology Research

　　影响因子：12.020

　　DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-1101

　　材料：3例ICC样本

　　文章概述：肝内胆管癌(ICC)是一种相对罕见但高度侵袭性的肿瘤类型，对化疗和免疫治疗反应较差。ICC全面的分子表征对开发新疗法至关重要。研究通过蛋白质组学特征获得了新的ICC肿瘤亚型，并揭示了亚型与预后的关联。

　　单细胞转录组测序鉴定出一个APOE+C1QB+巨噬细胞亚型，该亚型表现出重塑慢性炎症亚型的能力，并导致ICC的不良预后。此外，研究验证了APOE+C1QB+肿瘤相关巨噬细胞可作为潜在的免疫治疗靶点。

　　单细胞测序助力解析食管鳞状细胞癌分子图谱特征

　　Dissecting the single-cell transcriptome network underlying esophagus non-malignant tissues and esophageal squamous cell carcinoma

　　发表期刊：

　　EbioMedicine

　　影响因子：11.205

　　DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103459

　　材料：5个肿瘤组织和5个配对正常组织

　　文章概述：食管鳞状细胞癌（ESCC）是癌症中恶性和致命的癌症之一，尽管其治疗方面有一定进展，但总体预后的效果仍普遍较差。这种情况的产生与ESCC的高度异质性和肿瘤微环境（TME）密切有关。该研究通过GSVA、拟时序和细胞通讯等分析及实验验证证明了在ESCC肿瘤微环境中多种细胞存在的广泛的重编程过程。这些发现为对ESCC肿瘤微环境和异质性的研究提供了新的参考，并为未来的临床治疗提供了新的潜在治疗靶点。

　　单细胞测序助力解析新辅助化疗手段——紫杉醇+顺铂与单纯手术治疗在食管鳞状细胞癌中的肿瘤微环境差异

　　Dissecting the single-cell transcriptome network in patients with esophageal squamous cell carcinoma receiving operative paclitaxel plus platinum chemotherapy