“酶中战斗机”现身,PET塑料遇克星



“酶中战斗机”现身,PET塑料遇克星


塑料在为人类带来便利的同时,也导致了大量白色垃圾的出现,它们在自然界中的降解速度往往要以世纪为单位来进行计算。

不过,在一篇新发表于《自然》的研究中,研究人员借助AI机器学习系统,开发了一种新的PET塑料(聚对苯二甲酸乙二酯)水解酶,能在1周内降解50多种无需预处理的PET塑料。

“酶中战斗机”现身,PET塑料遇克星


48小时内,FAST-PETase将PET塑料容器完全降解

图片来源:参考文献1

这种酶到底牛在哪里?AI又是如何辅助酶开发的呢?

Part.1

生化反应的“魔法师”——酶

从高中课本中我们已经了解到酶是活细胞制造的某些特殊蛋白质(极少数是RNA),它们参与到生物体内一系列生化反应中,通过复杂而精妙的机制调控反应进行的速率、方向以及程度等,堪称是生物体内的魔法师。

但酶的作用环境早已不再局限于生物体内,在现代工业体系下我们可以人工制备生物酶,并将其用于洗涤剂、原油污染处理、生物质燃料制备、杀灭有害细菌等场合。这次新升级的PET水解酶就是人类最新研发的人工酶之一。

我们已经提到,酶的本质是蛋白质一类的生物大分子,那么蛋白质到底是一种怎样的物质,它们又是如何参与化学反应的呢?

蛋白质的组成单元是氨基酸,其结构非常简单。氨基酸结构上的中心是碳原子,它一侧连接氨基(-NH2,称为N端),另一侧连接羧基(-COOH,称为C端)。而与碳原子相接的侧链基团R,则会因氨基酸种类的差别而有所不同。

首先,某个氨基酸的氨基和另外一个氨基酸的羧基可以发生脱水缩合反应,形成-CO-NH-的连接方式,这就是肽键。实际中的蛋白质由一系列的氨基酸通过肽键聚合形成长链结构。

“酶中战斗机”现身,PET塑料遇克星


两个氨基酸脱水缩合的示意图

图片来源:wikipedia

但这一系列氨基酸又绝非沿着直线排列,而是会自发地形成某种空间结构,好比一根毛线绕成了线团。

最为神奇的是,这串氨基酸长链形成的“线团”,并非是随机“缠绕”形成,一旦组成蛋白质的氨基酸序列确定下来,它们的“缠绕”方式也会确定,这就是所谓的“蛋白质折叠”。

“酶中战斗机”现身,PET塑料遇克星


蛋白质的四级结构(左)及蛋白质数据库中多样化的蛋白质(右)

图片来源:OpenStax College

真正让蛋白质能够发挥生理活性的关键,是它们特殊的空间结构,一旦这种空间结构被破坏(比如煮熟的鸡蛋),就算组成蛋白质的氨基酸序列不发生变化,蛋白质所能行使的生理机能也会减弱、失活甚至是失控。

蛋白质行使生理机能的本质是参与各种化学反应,它们复杂的多样性意味着它们所能参与的反应也有无限多的可能。

而酶作为特殊的蛋白质,更是在调控生物化学反应方面发挥着巨大作用,它们往往扮演着催化剂的角色,在酶存在的条件下,生化反应速率能够提高上亿倍。

Part.2

酶中战斗机——PET降解酶

全球每年产生和消费的PET总量占到全球塑料消费总量的六分之一,大约为1亿吨,大部分的透明饮料瓶都是PET所制。

虽然PET是循环利用率最高的塑料制品之一,但最终实现循环利用的PET制品也只有不到一半的数量。

由于PET这类高聚物中各单体间的化学键很难被普通方式破坏,在普通的塑料回收过程中,仅仅可以实现原料的降级再利用。

例如食品级PET塑料瓶回收后用来加热溶解成PET颗粒,之后重新进行热加工,制成PET纤维,再利用纤维制造塑料绳或者塑料袋等。

而PET降解酶却可以直接破坏这种高聚物中的化学键,将其还原为对环境影响很小的对苯二甲酸和乙二醇。

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PET回收利用的经典路线:分类——碾碎——制粉——化学纤维——环保编织袋

图片来源:参考文献3




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