DNA测序样品可以用TE溶液进行溶解吗?



TE溶液中的EDTA对PCR反应有抑制作用,实际上DNA测序是在PCR反应过程中进行的,想要得到一个理想的测序结果,需要PCR反应条件。因此,哈尔滨全基因合成在准备DNA测序样品时,建议您使用灭菌水进行溶解。

对于通用测序引物,只要正确使用,一般不会有太大问题,测序引物问题主要发生在客户自己提供的PCR引物上。应该明确的一点是并不是所用的用于PCR的引物都可以用来作测序,哈尔滨全基因合成以下几种PCR引物将是不适合用作测序引物的:

(1)简并引物,简并引物必然要在测序模板上有多个结合位点,直接影响测序结果。

(2)随机引物,如RAPD引物,随机引物一般都比较短,所用退火温度低,在测序反应的条件下,不能很好地与模板结合。

(3)过长的引物,一般要求测序引物不大于24bp,最长不能超过30bp。过长的引物在测序反应的较低的条件下容易在测序模板上有多个结合位点,导致测序结果背景增高。另外,较长的引物纯度也将难以保证。哈尔滨全基因合成通常用于测序的引物纯度要在90%以上,引物纯度低时,测序反应的背景将明显增大,直接影响到测序结果。

哈尔滨全基因合成

(4)有特殊标记的引物,该情况主要指荧光标记的引物。我们测序反应的四种碱基都是荧光标记的,这样,荧光标记的引物将产生干扰。另外,其他一些有大的标记基团的引物也不要用于测序。引物上大的标记基团将直接影响到DNA片段的迁移率,导致测序结果峰型不好或错误。




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