北大再突破,为抗癌提供强大武器!



癌症作为一种细胞异常增殖的疾病

是全球主要的公共卫生问题

近日,北大杜鹏课题组揭示

植物免疫蛋白通过挽救miRNA缺陷

实现广谱抗肿瘤反应

这一发现为人类战胜癌症

提供了强大武器



01

诱发癌症的

罪魁祸首


癌症的诱因非常复杂,是胞内多种调控通路的突变和微环境共同作用的结果,其中微小RNA(miRNA)是近年来被认为与癌症发生息息相关的重要RNA分子。在哺乳动物中,具有2-nt 3'末端悬垂的成熟miRNA双链可以被Argonaute(AGO)识别并装载形成RNA诱导的沉默复合体(RISC)进而调控靶基因的表达。在癌症中,全局miRNA剂量减少被认为是癌症发生的诱因之一。然而,迄今为止对于不同癌症中普遍miRNA缺乏的原因尚未被系统陈述。

细胞周期的过度激活是癌细胞异常增殖的必要条件,因此细胞周期基因是抗癌药物研发的重要靶点。现有细胞周期的药物往往只能针对一种或者几种靶点,因而无法克服基因冗余性而带来的耐药性。有意思的是,许多miRNA都可以直接靶向并抑制细胞周期基因,从而直接控制细胞增殖。因此,能否通过修复肿瘤中有缺陷的miRNA通路从而实现对于肿瘤细胞增殖的抑制,就一直是一个悬而未决的生物学问题。一旦成功,则可开发成为一种肿瘤治疗的新策略。

与miRNA不同,siRNA来源于不同RNA依赖性RNA聚合酶 (RDR) 合成的双链RNA底物。有趣的是,RDR几乎在所有真核生物中都已被发现,但在进化过程中,其在具有次级免疫系统的脊椎动物中丢失。在植物中,依赖RDR1的siRNA尤其参与抗病毒免疫反应,是植物特有的、最核心的分子免疫反应通路之一。近年来,跨物种生物工程已成功应用于基础研究和转化医学,例如来自细菌的Crispr-Cas。因此,我们尝试从动植物免疫系统的差异出发,在哺乳动物中进行基于植物RDR1的植物基因工程,并研究其相关的转化医学的应用。

2022年5月26日,北京大学杜鹏课题组在Cell杂志在线发表了题为“A plant immune protein enables broad antitumor response by rescuing microRNA deficiency” 的研究论文。该研究发现:

在不同的人类原发性癌症样本和癌症细胞系中,不能有效结合AGO2复合体的3’末端短1-nt的miRNA异构体广泛积累。异位表达的植物免疫蛋白RDR1通过其单核苷酸加尾修饰这些AGO2游离出的miRNA双链异构体,以重新激活有缺陷的miRNA通路,从而特异性阻断实体瘤和白血病中癌细胞的细胞周期。



02

振奋人心的

研究结果



在本研究工作中,作者主要有以下4个发现:


RDR1蛋白通过靶向细胞周期广泛抑制癌细胞的增殖

为了在哺乳动物细胞中进行基于植物RDR1的生物工程,作者分别从拟南芥(At)和水稻(Os)中克隆RDR1基因到基于Dox诱导的慢病毒载体上。最终,本研究获得了13个稳定的RDR1诱导细胞系(包括7个实体瘤、3个白血病、3个非癌症细胞系)和2个RDR1恒定表达的胚胎干细胞系。通过Western blot和活细胞成像,作者验证了RDR1在哺乳动物细胞中成功实现了异位表达。

在接下来的研究中,令作者惊讶和意外的是,AtRDR1和OsRDR1能够在体外显著抑制所有10种癌症细胞系的增殖,但对其他5种非癌细胞没有影响。RDR1还可以显著抑制癌细胞的克隆形成能力。在分子水平上,基于RNA-seq的基因集富集分析(GSEA)表明,AtRDR1和OsRDR1可以干扰所有癌症细胞系中的细胞周期过程,但在非癌对照细胞中没有明显作用。

值得注意的是,短时间(2-3天)诱导RDR1同样可显著抑制癌细胞中的细胞周期过程,表明细胞周期通路可能是RDR1的直接作用靶点。随后,EdU/PI染色分析显示,RDR1在癌细胞中的表达显著降低了S期的细胞比例,反而增加了G0/G1期的细胞比例。因此,作者认为植物免疫蛋白RDR1是一种外源肿瘤抑制因子,它能够特异靶向并干扰癌细胞中的细胞周期过程,但在非癌症细胞中却不起作用。


AtRDR1和OsRDR1广谱且特异的抑制癌细胞增殖,但不影响非癌细胞系


RDR1能够特异靶向并干扰癌细胞的细胞周期,但对非癌细胞不起作用



3’末端短1-nt的miRNA异构体在多种肿瘤中广泛积累





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