Western Blot蛋白免疫印迹原理及常见问题(FAQ)@南京

作者：张馨予

1. Western blot结果中的背景为什么较高?

可能的原因及建议

膜封闭不够——延长封闭的时间；选择更加适合的封闭液。

一抗稀释度不适宜——对抗体进行滴度测试，选择最适宜的抗体稀释度。

一抗孵育的温度偏高——建议4℃结合过夜。

膜在实验过程中干过——实验过程中要注意保持膜的湿润。

检测时曝光时间过长——减少曝光时间。

2. Western blot结果中杂带较多

可能的原因及建议

目的蛋白有多个修饰位点（磷酸化位点、糖基化位点、乙酰化位点等），本身可以呈现多条带。
查阅文献或进行生物信息学分析，获得蛋白序列的修饰位点信息，通过去修饰确定蛋白实际大小。

目的蛋白有其它剪切本——查阅文献或生物信息学分析可能性。

样本处理过程中目的蛋白发生降解——加入蛋白酶抑制剂；样本处理时在冰上操作。

上样量过高，太敏感——适当减少上样量。

一抗特异性不高——重新选择或制备高特异性的抗体。

一抗不纯——纯化抗体

一抗或者二抗浓度偏高——降低抗体浓度。

3. Western blot结果中无信号或显示信号弱

可能的原因及建议

检测样本不表达目的蛋白——选择表达量高的细胞作为阳性对照，用于确定检测样本是否为阴性。

检测样本低表达目的蛋白——提高上样量，裂解液中注意加入蛋白酶抑制剂。

转移不完全或过转移——可以用丽春红染膜并结合染胶（考马斯亮蓝）后确定条带是否转至膜上或转移过头；适当调整转膜的时间和电流。

抗体不能识别测试种属的相关蛋白——购买抗体前应当认真阅读抗体说明书，确定其是否能够交叉识别测试种属的对应蛋白。

一抗孵育时间不足——建议4℃结合过夜。

二抗与一抗不匹配——选择针对一抗来源的种属的抗体。

洗膜过度——洗膜时间不宜过长，加入的去垢剂不宜过强或过多，建议使用0.1%的弱去垢剂Tween-20。

4. 其它现象：

膜上多处出现黑点或黑斑——抗体与封闭试剂发生非特异性的结合。

反白（条带显白色）——目的蛋白含量太高或者一抗浓度偏高。

蛋白分子量偏低或偏高——胶浓度不适合，高分子量要用低浓度胶；小分子蛋白要用高浓度胶。

5. TBS与PBS的区别

PBS的缓冲能力强于TBS（因为混合缓冲液在一定的离子强度下常常具有更宽的缓冲范围），TBS在PH7.0以下缓冲能力较弱（不过PBS易污染）。但我们常常要根据我们实验目的选用合适的缓冲液，如在蛋白纯化中进行阴离子交换层析，阳离子缓冲液首选TBS；阳离子交换层析时，阴离子缓冲液则首选PBS。
Western blot中使用TBS和PBS均可，只是要根据需要选择合适的浓度。

6. Western是否可以同时加两种或者多种一抗

通常情况下只加一种一抗。做Western在同一张膜上检测目的蛋白和内对照，也是先上目的蛋白的一抗、二抗，ECL显色、压片、洗片；漂洗以后，再上内对照的一抗、二抗，ECL显色、压片、洗片。

7. PVDF与NC膜的区别

PVDF膜价格较贵，可重复使用，结合能力较强。

NC膜价格比较便宜，应用较广，结合牢固性较PVDF膜差，韧性也不如PVDF，不能重复使用，但蛋白吸附容量高，亲水性较好。

8. Western一抗的选用

理论上单抗比多抗的特异性要好，但单抗种类较少一般价格偏高，所以一般来说多抗足够了。

9. Western抗体和ELISA抗体的区别

一般来说用于western的抗体主要识别氨基酸序列特异性；而可用于ELISA的抗体则要看抗原种类，有些是识别氨基酸序列特异性，有些是识别构像特异性。所以一般根据抗体说明书来确定。

做免疫印迹时选择抗体主要应考虑两个问题，一是所选抗体是否能识别凝胶电泳后转印至膜上的变性蛋白，另一个是所选抗体是否会引起交叉反应条带。

10. “短路”现象的产生和处理

如果纸、膜比凝胶大就比较容易形成短路了，上下两层虑纸也不能因过大而相互接触，这样同样会短路，电流不会通过胶和虑纸。转移前和转移过程中看看电压就行，正常的半干是慢慢变高的，最后结束时一般是开始的1.5-3倍都是正常的。一般Buffer和滤纸选的对就不会短路。

11. Western Blot的染色

阴离子染料是较常用的，特别是氨基黑，脱色快，背景低检测极限可达到1.5μg，考马斯亮蓝虽然与氨基黑有相同的灵敏度，但脱色慢，背景高。丽春红S和快绿在检测后容易从蛋白质中除去，以便进行随后的氨基酸分析。缺点是：溶剂系统的甲醇会引起硝化纤维素膜的皱缩或破坏。不能用语正电贺的膜。灵敏度低。

胶体金，灵敏度高，检测范围可到pg级，但染色比稳定。

生物素化灵敏度位于1、2之间，可用于任何一种膜。

12. 大分子量蛋白转移效率低的解决方法