浅谈应用ARMS方法检测病理组织标本基因突变



随着医学研究的不断发展,对肿瘤的靶向治疗已更加成熟,而靶向治疗的前提是对药物的分子靶点进行基因检测。目前比较常用的检测方法主要有:直接测序法、PCR-RFLPdHPLC法、及实时荧光PCR法等。本文简要讨论一下与实时荧光PCR法相关的ARMS技术。

突变扩增阻滞系统(amplification refractory mutation systemARMS)是PCR技术应用的发展,用于对已知突变基因进行检测。其利用PCR引物的3 端碱基必须与模板DNA互补才能有效扩增的原理,设计等位基因特异性扩增引物,在严格的条件下,只有在引物3 端碱基与模板配对时才能进行PCR反应,从而检测出突变。利用ARMS技术合并荧光探针,在实时荧光PCR平台上对样本DNA进行基因突变检测,即为目前广泛应用的检测分子靶点基因突变的方法。

ARMS方法应用于病理组织标本基因突变检测的优势主要有以下几点:

1、检测灵敏度高,可达到1%,对于一些无法获得手术组织的患者,只能采取穿刺等方法进行诊断、检测,而以这种方式获得的标本组织量少,多数在满足病理诊断后已所剩无几,而ARMS方法的高灵敏度对这种类型标本的检测有很大优势。

2、病理组织标本为石蜡包埋标本,因甲醛的固定使得组织的DNA大部分片段化,ARMS方法在设计上缩短了目标产物的长度,适用于这种片段化的DNA标本。

3、该方法结合实时荧光PCR实现扩增时闭管操作,操作简单,无需产物的后处理,直接读取结果,避免扩增产物的污染。

4、由于实时荧光PCR检测系统已十分成熟,因此,检测结果数据的分析较简便快捷。

5、对于无法获得病理组织标本的患者,如能获得胸水等体液标本,也可尝试进行检测。

此方法也有不足之处:即试剂成本较高,并无法检测未知类型的突变。

综上所述,ARMS方法作为一种简便、快捷、高灵敏度的基因检测方法,已被广泛应用于靶向分子如EGFRALKROS1KRASBRAF等基因的检测,在疾病的诊疗中起到重要作用。




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