PAGE变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 3700字】范文118



实验六 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳法—蛋白质的分子量测定

【实验目的】

1.掌握SDS—聚丙烯酰胺电泳法的原理。

2.学会用此种方法测定蛋白质的分子量。

【实验原理】

SDS—聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)是对蛋白质进行量化,比较及特性鉴定的一种经济、快速、而且可重复的方法。该法主要依据蛋白质的分子量对其进行分离。SDS与蛋白质的疏水部分相结合,破坏其折叠结构,并使其稳定地存在于一个广泛均一的溶液中。SDS—蛋白质复合物的长度与其分子量成正比。由于在样品介质和聚丙烯酰胺凝胶中加入离子去污剂和强还原剂后,蛋白质亚基的电泳迁移率主要取决于亚基分子量的大小,而电荷因素可以被忽略。SDS—PAGE因易于操作和广泛的用途,使它成为许多研究领域中一种重要的分析技术。

SDS是十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate)的简称,它是一种阴离子表面活性剂,加入到电泳系统中能使蛋白质的氢键和疏水键打开,并结合到蛋白质分子上(在一定条件下,大多数蛋白质与SDS的结合比为1.4gSDS/1g蛋白质),使各种蛋白质—SDS复合物都带上相同密度的负电荷,其数量远远超过了蛋白质分子原有的电荷量,从而掩盖了不同种类蛋白质间原有的电荷差别。这样就使电泳迁移率只取决于分子大小这一因素,于是根据标准蛋白质分子量的对数和迁移率所作的标准曲线,可求得未知物的分子量。

【实验材料】

1.实验器材

微型凝胶电泳装置;电源(电压200V,电流500mA);100℃沸水浴;Eppendorf管;微量注射器(50μl或100μl);干胶器、真空泵或水泵;带盖的玻璃或塑料小容器;摇床。

2.实验试剂

⑴ 2mol/L Tris-HCl (pH8.8):取24.2g Tris, 加50ml蒸馏水,缓慢的加浓盐酸至pH8.8(约加4ml);让溶液冷却至室温,pH将会升高,加蒸馏水至100ml。

⑵ 1mol/L Tris-HCl (pH8.8):取12.1g Tris, 加50ml蒸馏水,缓慢的加浓盐酸至pH6.8(约加8ml);让溶液冷却至室温,pH将会升高,加蒸馏水至100ml。

⑶ 10% (w/v) SDS: 取10g的SDS,加蒸馏水至100ml。

⑷ 50% (v/v) 甘油: 取50ml 100%甘油,加入50ml蒸馏水。

⑸ 1% (w/v) 溴酚蓝:取100mg溴酚蓝,加蒸馏水至10ml,搅拌,直到完全溶解,过滤除去聚合的染料。

⑹ A液--丙烯酰胺储备液(配制含30% (w/v) 丙烯酰胺和0.8% (w/v) 甲叉双丙烯酰胺的溶液100ml)在通风柜中操作,取29.2g丙烯酰胺,0.8g甲叉双丙烯酰胺,加蒸馏水至100ml,缓慢搅拌直至丙烯酰胺粉末完全溶解,用石蜡膜封口,可在4℃存放数月。

⑺ B液--4×分离胶缓冲液:取75ml 2mol/L Tris-HCl (pH8.8),加入4ml10%SDS, 加21ml蒸馏水,混匀,可在4℃存放数月。

⑻ C液--4×浓缩胶缓冲液:取50ml 1mol/L Tris-HCl (pH6.8),加入4ml10% SDS, 加46ml蒸馏水,混匀,可在4℃存放数月。

⑼ 10%过硫酸铵:取0.5g过硫酸铵,加入5ml蒸馏水,可保存在密封的管内,于4℃存放数月。

⑽ 电泳缓冲液:取3g Tris,14.4g甘氨酸,1g SDS,加蒸馏水至1L, pH约为8.3, 也可配制成10×的储备液,在室温下长期保存。

⑾ 5×样品缓冲液:取0.6ml 1mol/L Tris-HCl (pH6.8),加入2ml 10% SDS, 5ml 50%的甘油,0.5ml 2-巯基乙醇,1ml 1%溴酚蓝,0.9ml的蒸馏水混匀,可在4℃保存数周,或在-20℃保存数月。

⑿ 考马斯亮蓝染液:1.0g 考马斯亮蓝R-250,加入450ml甲醇,450ml蒸馏水及100ml冰醋酸即成。

⒀ 考马斯亮蓝脱色液:将100ml甲醇,100ml冰醋酸,800ml蒸馏水混匀备用。

【实验操作】

1.灌制分离胶

⑴ 组装凝胶模具: 可按照使用说明书装配好灌胶用的模具。对于Bio-Rad的微型凝胶电泳系统,在上紧螺丝之前,必须确保凝胶玻璃板和隔片的底部与一个平滑的表面紧密接触,有细微的不匹配就会导致凝胶的渗漏。

⑵ 将A液、B液及蒸馏水在一个小烧瓶或试管中混合,丙烯酰胺(A液中)是神经毒素,操作时必须戴手套。加入过硫酸铵和TEMED后,轻轻搅拌使其混匀(过量气泡的产生会干扰聚合)。凝胶很快会聚合,操作要迅速。小心将凝胶溶液用吸管沿隔片缓慢加入模具内,这样可以避免在凝胶内产生气泡。

⑶ 当加入适量的分离胶溶液时(对于小凝胶,凝胶液加至约距前玻璃板顶端1.5cm或距梳子齿约0.5cm),轻轻在分离胶溶液上覆盖一层1mm~5mm的水层,这使凝胶表面变得平整。当凝胶聚合后,在分离胶和水层之间将会出现一个清晰的界面。

2.灌制浓缩胶

⑴ 吸尽覆盖在分离胶上的水后将A液、C液和蒸馏水在三角烧瓶或小试管中混合。加入过硫酸铵和TEMED,并轻轻搅拌使其混匀。

⑵ 将浓缩胶溶液用吸管加至分离胶的上面,直至凝胶溶液到达前玻璃板的顶端。将梳子插入凝胶内,直至梳子齿的底部与前玻璃板的顶端平齐。必须确保梳子齿的末端没有气泡。将梳子稍微倾斜插入可以减少气泡的产生。




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