只有约0.05％进行了基因测序，印度的“新冠盲区

作者：王韵壹、李英、熊慧卿

　　所有Covid-19病例中只有约0.05％进行了基因测序，这一事实被认为是印度爆发新感染的原因之一。

　　根据美国广泛研究所的跟踪工具Covid-19 CG的数据，印度在134个国家/地区中以基因测序的感染率排名第85位。

　　在所有印度病例中，只有约0.05％进行了基因测序。作为对比，澳大利亚为47.4％，英国为7.7％，美国为0.75％。

　　许多国家都认为基因测序是对抗Covid-19的必不可少的工具。此过程涉及从一名患者中采集Covid-19样本，并将其与其他患者的病毒样本进行比较。

　　如果未明确感染源，则比较测试结果可有助于追溯。同时，它可以助于更准确地发现和隔离与病人接触过的人。

　　显然，基因测序不足的国家是反流行病地图上的“盲点”。在那些国家中，一种菌株可以被发现并传播到许多国家，然后才被发现。科学家尚未确定这三种菌株在英国，南非和巴西是首次发现的地方。

　　同时，印度是世界第二大人口大国，每天都有成百上千的新感染发生，这有可能成为形成菌株的“盲区”。

　　麻省理工学院和哈佛大学广泛的基因和细胞研究员艾琳娜·陈（Alina Chan）说：“感染的人越多，菌株形成的风险就越高。”

　　4月15日在新德里一家医院的Covid-19患者。

　　“在模棱两可中奋斗”

　　印度实践与发展政策中心研究主任阿米尔·乌拉·汗（Amir Ullah Khan）博士说：“我们正在努力解决这种模棱两可的问题。目前尚无有关如何测试病毒株的数据或讨论。”

　　印度是世界上Covid-19感染率最高的国家。4月18日，印度卫生部表示，该国在过去24小时内记录了261,500例新的Covid-19感染。据《印度时报》报道，这是新的纪录增长，并且是印度新感染人数连续第四天超过200,000例/天。

　　今年三月，印度卫生部表示，其实验室已经在收集的样本中检测到了所有三种菌株（英国，南非和巴西），其中包括一种可能是印度本土的新的“双重突变菌株”。该菌株携带两个突变，这些突变以前曾被单独发现过，但从未在同一菌株上见到过。

　　科学家对此菌株知之甚少。但是它随时间传播。斯坦福大学的本杰明·平斯基（Benjamin Pinsky）博士说，他是在3月24日印度政府发布信息时首次听说这种菌株的。第二天，他的实验室在从加利福尼亚州一名患者身上采集的样本中发现了相同的变异。在过去的三周中，已确诊该菌株6例，疑似病例10例。至少有一个人去过印度。

　　印度综合生物学和CSIR生物学研究所所长Anurag Agrawal博士说，它们每个月可以测序25,000至30,000个基因样品。但是，平均而言，他们每个月只能制作大约4,000个样本，因为当感染率较低时，该数目足以确定主要变异。

　　去年，由于这些变体的基因测序延迟，浪费了很多时间。依目前的情况看来，印度并没吸取教训！

　　毕竟，没有更积极的SARS-CoV-2基因测序计划，像印度这样的国家将没有足够的数据来进行疾病控制。

　　同时，由于缺乏有关变体的信息，因此也难以评估现有疫苗的有效性。

　　许多障碍

　　Agrawal博士说，印度正在努力对SARS-CoV-2基因组进行测序，以鉴定受影响最严重地区的主要病毒株。

　　在旁遮普邦，变体B117（在英国首次发现）是最常见的变体。同时，在马哈拉施特拉邦，双重派系占主导地位。毫无疑问，随着情况的恶化，在这一节点上需要做更多的基因测序。

　　尝试促进基因测序的问题与去年最初发布的Covid-19相似。障碍包括政府严格控制和该国私营部门参与。在印度，由10个国家实验室进行基因组测序的工作。

　　一名工人在印度接受Covid-19的测试

　　在宣布在新冠大流行反疫获胜之后，许多为实验室提供了Covid-19阳性样本的测试设施被废弃了。政府的重点已经转移到疫苗接种运动上，而不是确定哪些病毒株正在引起当前的感染浪潮。

　　照此下去，那么你认为，印度会何时迎来抗疫转机呢？