环状RNA/DNA研究新进展！

作者：张馨予

本文中，小编整理了科学家们近年在环状DNA/RNA研究领域取得的研究进展，分享给大家！

环状RNA/DNA研究新进展！

图片来源：Cancer Cell

【1】Cancer Cell：环状RNA限制皮肤癌的转移

doi：10.1016/j.ccell.2019.12.007

近日，一项刊登在国际杂志Cancer Cell上的研究报告中，来自纽约大学的科学家们通过研究发现，一种神秘的遗传物质可以抑制皮肤癌细胞的扩散，但随着它们的成熟，这种物质往往会丢失。通常，DNA被转化成RNA，然后转化成具有细胞功能的蛋白质。虽然大多数RNA是线性分子，但当它们的末端循环并附着时，有些会形成圆圈。

研究者表示，环状RNA (circRNA)不编码蛋白质，而是复杂调控系统的一部分，但其功能仍不清楚。这项在细胞培养和小鼠身上进行的研究，首次证明了一种名为CDR1as的环状RNA可以阻止黑色素瘤的恶性扩散，而它的缺失则会促进这种扩散。一项对人类黑素瘤组织的研究分析也表明，CDR1as水平升高与存活率增加有关。黑素瘤是皮肤癌中最致命的一种，癌症细胞的侵袭性扩散或转移是黑素瘤患者死亡的主要原因。由于基因错误，癌细胞从正常细胞中产生，但DNA的变化并不能完全解释细胞是如何扩散的。

【2】Science：科学家在动物组织中发现大约600种新的环状DNA病毒

doi：10.1101/2020.01.28.923185

病毒是地球上最神秘的生物之一。它们是世界上最小的生命形式之一。鉴于没有宿主它们就不能存活和复制，因此一些科学技质疑它们应当被视为生物。如今，包括巴西米纳斯吉拉斯联邦大学病毒学家J？natas Abrah？o在内的一个研究团队发现一种病毒具有无法识别的基因，这使得它成为所有已知病毒中最奇怪的一种。但是，我们真正知道多少种病毒？另一个研究团队刚刚发现了数千种新病毒，它们潜藏在数十种动物的组织中。

研究者表示，这些发现说明了我们对病毒“还有很多仍然需要去了解”。Abrah？o在搜寻巨病毒时发现了这种病毒。巨病毒的大小与细菌相当。2003年，它们首次是在变形虫中发现的。在一个当地的人工湖中，他和他的同事们不仅发现了新的巨病毒（giant virus），而且发现了一种巨病毒由于其体积小而与大多数感染变形虫的巨病毒不同；他们将它命名为Yaravirus。

【3】Nat Genet：染色体外环状DNA驱动神经母细胞瘤癌基因重构

doi：10.1038/s41588-019-0547-z

近日，纪念斯隆凯特林癌症中心等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章，发现染色体外环状DNA驱动神经母细胞瘤癌基因重构。染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNAs，eccDNAs)产生于染色体上的序列，在起源上有较高的异质性，可以影响细胞生命活动，促进肿瘤细胞演进和适应性进化，是肿瘤的重要基因组特征。然而，对于染色体外环状DNA的结构、组成和全基因组频率仍然缺乏较为广泛而深入的研究。

研究人员结合基因组学和转录组学的方法分析了神经母细胞瘤（一种起源于儿童期的由交感神经系统原始细胞产生的肿瘤）中的染色体外环状DNA的图谱，鉴定并表征了广泛来源于体细胞的和未被报道的体外染色体环状DNA。此外，还意外发现染色体外环状DNA是体细胞基因组重排的主要来源，可以通过嵌合体循环和将环状DNA重新整合进线性基因组，促进癌基因重塑。肿瘤引起的病变可能会出现环状DNA外衍生的重排，并与不良的临床结果相关。环状DNA衍生的重排很可能是一个持续的突变过程。因此，染色体外环状DNA是一个多点突变过程，对肿瘤基因组重塑的起源具有重要的功能和临床意义。

【4】Nat Genet：重磅！绘制出首张儿童癌症环状DNA图谱染色体外环状DNA或在儿童癌症发生中扮演关键角色！

doi：10.1038/s41588-019-0547-z

随着时间推移，癌症的发生往往与DNA缺陷的逐渐积累有关，因此，癌症通常会被认为是一种年龄相关的疾病，那么为何儿童也会患癌呢？近日，一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中，来自德国夏洛蒂—洪堡大学和柏林自由大学附属医学中心等机构的科学家们通过研究发现，染色体外环状DNA或会促进儿童癌症的发生，文章中，研究人员绘制出了首个儿童癌症环状DNA精细化图谱，有望揭示儿童患癌的原因并开发新型的治疗策略。

文章中，研究人员发现，染色体外环状DNA或会破坏遗传信息，从而促进癌症发生。如今科学家们对环状DNA已经熟知很多年了，其并不能形成正常的遗传物质，而是会被储存在染色体中，然而其通常被称为染色体外环状DNA，但科学家们对于这种环状DNA知之甚少，主要是因为她们缺少技术来详细分析这种环状DNA。这项研究中，研究人员将先进的技术与生物信息学技术相结合绘制出了首个神经母细胞瘤（一种致死性的儿童癌症）环状DNA图谱，基于该图谱，研究人员就有望阐明这种类型癌症发生的分子机制和原因。

【5】PLoS Genet：新型环状磷酸RNA分子或在机体衰老过程中扮演关键角色

doi：10.1371/journal.pgen.1008469