2017北京市计算中黄曲霉毒素m1心8月培训班通知

作者：王韵壹、李英、熊慧卿

(课程内容以实际授课为准)

注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。

【报名费用】注册费：3500元/人（含听课费、资料费、上机费，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）。

【报名优惠政策】

1、7.15日前报名缴费的学员每人可优惠300元，

2、3人以上团体报名每人可减少300元；

3、4+1团报，可免费赠送一个名额

4、同时报2个以上培训班的可额外优惠200元

5、上面4种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。

8.5-6宏基因分析专题研讨班

培训时间：2017.8.5-6 9:30-12:00 13:30-17:00

　　日期　　授课题目 　　授课内容
　　第一天　　宏基因学研究的发展和挑战　　1、宏基因组研究的发展历史　　2、典型的宏基因组研究及应用　　3、两种宏基因组研究的策略　　4、宏基因组数据分析中的挑战　　5、数据分析过程中的编程简介
　　QIIME在宏基因组分析中的应用（上机操作）　　1．linux常用命令使用和上机操作　　2、单样品物种多样性分析　　A）序列聚类OTUs（Operational Taxonomic Units）　　B）测序深度判定（Rarefaction Curve）　　C）物种多样性及丰度分析（Relative Abundances）　　3、多样品物种多样性分析，包括以下内容：　　A）多样品OTUs比较（OUT Heatmap、Venn图）　　B）多样品相似度比对（UPGMA 聚类分析）　　C）多样品群落构成比较分析（柱状图）　　D）Weighted PCA（Principal Component Analysis）分析　　E）Unweighted PCA分析　　F）组间差异显著性分析
　　第二天上午　　基于shotgun测序的宏基因组数据分析技术　　一、WGS测序分析的一般流程 1 流程概览　　2 文库构建和测序方式选择　　3 质量控制和污染序列去除　　4 序列整合和分选　　5 NR-BLAST和MEGAN分析　　6 序列拼接和基因预测注释　　7 循环处理　　二、经常使用的数据资源和工具（重点）　　1 NR/MG-RAST和reference　　2 RAPSearch和alignment　　3 MEGAN和classification　　4 SOAP-denovo和assembly　　5 BWA/inGAP和mapping　　三、数据统计与结果展示（重点）　　1 测序量和拼接效率　　2 从比对文件中提取信息　　3 物种/功能分类和组成　　4 群落结构多样性　　5 聚类和相关性　　6 其它…… 　　四、WGS测序分析的典型案例　　1 人类微生物组计划-HMP　　2 地球微生物组计划-EMP　　3 反刍动物胃宏基因组　　4 环境病毒组和噬菌体　　5 从相关案例看WGS的优势　　五、一些工具的操作演示（上机）
　　第二天下午　　宏基因组研究的难点：宏基因组拼接非拼接策略的数据分析　　1.宏基因组拼接必要性　　2.基因组拼接组装算法原理和流程　　3. 宏基因组拼接的特点及难点　　4. 基于非拼接的宏基因组研究策略　　5.上机操作，演示SOAPdenovo2, MetaIDBA， SPAdes等软件的使用

【注】：以上课程信息实际上课为准

【收费标准】注册费2500元/人，包括学费、资料费、上机费。培训期间可免费提供午餐。

【报名优惠政策】1、7.15日前报名并缴费的学员每人可优惠300元； 2、3人以上团体报名每人可减少300元； 3、4+1团报，可免费赠送一个名额 4、同时报2个以上培训班的可额外优惠200元 5、上面4种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

8月7-11日实用生物信息学研讨班

本次课程时间：2017.8.7-11 上午：9:30-12:00下午：13:00-16:30