科企岛：“数字生物学的新时代” 人工智能揭示
科企岛：“数字生物学的新时代” 人工智能揭示了几乎所有已知蛋白质的结构
2022-08-01 17:53 来源: 科企岛
原标题：科企岛：“数字生物学的新时代” 人工智能揭示了几乎所有已知蛋白质的结构
一年会带来多大的改变。十二个月前，人工智能（AI）公司DeepMind公布了约35万种蛋白质的预测结构，震惊了许多科学家，这是被公认为《科学》杂志2021年年度突破的一部分。昨天，DeepMind及其合作伙伴走得更远。该公司公布了几乎所有已知蛋白质的可能结构，从细菌到人类的蛋白质超过2亿，这是人工智能的一项惊人成就，也是药物开发和进化研究的潜在宝库。
“我们现在正在发布整个蛋白质宇宙的结构，”DeepMind的创始人兼首席执行官Demis Hassabis在伦敦举行的新闻发布会上说。
结构赏金来自AlphaFold，这是一个新的人工智能程序，它解决了蛋白质折叠问题，这是从氨基酸序列中准确推导出蛋白质3D形状的长期挑战。AlphaFold新预测的结构昨天通过与欧洲分子生物学实验室的欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）的合作发布到现有数据库中。该数据库“为结构生物学家提供了这种强大的新工具，您可以在其中查找蛋白质的3D结构，几乎与进行关键字Google搜索一样容易，”Hassabis说。
斯克里普斯研究转化研究所所长埃里克·托波尔（Eric Topol）回应了许多外部科学家的惊讶。“AlphaFold是生命科学领域独特而重大的进步，展示了人工智能的力量，”他在推特上写道。“随着这种新增加的结构照亮了几乎整个蛋白质宇宙，我们可以期待每天有更多的生物奥秘得到解决。
对于生命科学领域#AI来说，这是一个重要的日子。从开源#AlphaFold发布>2亿预测的3D蛋白质结构，几乎整个蛋白质世界。DeepMind结构发布是“了不起的”，EMBL副总干事Ewan Birney在新闻发布会上说。“这将使世界各地的许多研究人员思考他们现在可以做哪些实验。
AlphaFold解决的蛋白质来自从细菌到植物再到脊椎动物的生物体，包括小鼠，斑马鱼和人类。DeepMind研究科学家Kathryn Tunyasuvunakool表示，AlphaFold大约需要10到20秒才能对每种蛋白质进行预测。她指出，该公司必须与EMBL-EBI密切合作，以弄清楚如何在数据库中呈现大量结构。
DeepMind表示，自去年推出该数据库以来，已有超过50万名研究人员使用过该数据库。Hassabis预测了一个“数字生物学的新时代”，在这个时代，药物开发人员可以从AI预测的对任何医疗条件都很重要的蛋白质结构转向使用AI来设计影响这些蛋白质的小分子，从而治疗疾病。
其他人正在使用结构预测来开发候选疫苗，探索基本的生物学问题，例如所谓的核孔复合物如何使分子进入细胞核，或者检查生命首次进化时蛋白质的进化。
然而，哈萨比斯警告说，释放这些结构只是一个起点。“显然，仍然有很多生物学和许多化学，必须完成。返回搜狐，查看更多
上一篇：哈佛遗传学教授的抗衰秘籍，生理年纪可以年轻
下一篇：广东医科大学《701细胞生物学》考研科目参考书