云南省烟草农业科学研究院2022年蛋白组学分析、高通量数据分析及文库构建、代谢组学检测招标公告
云南省烟草农业科学研究院2022年蛋白组学分析、高通量数据分析及文库构建、代谢组学检测招标公告
1.招标条件
昆明华辰招标代理有限公司受云南省烟草农业科学研究院委托，就云南省烟草农业科学研究院2022年蛋白组学分析、高通量数据分析及文库构建、代谢组学检测项目（项目编号：HCZB02202205025）进行公开招标，项目已具备招标条件，欢迎具有相应资格的单位参与投标。
2.项目概况
2.1项目名称：云南省烟草农业科学研究院2022年蛋白组学分析、高通量数据分析及文库构建、代谢组学检测。
2.2招标范围：负责完成云南省烟草农业科学研究院2022年蛋白组学分析、高通量数据分析及文库构建、代谢组学检测，并出具检测报告。
2.3标包划分：
标包 项目名称 检测项目 分项 规格 一标包 蛋白组学 蛋白组学分析 基于TMT或iTRAQ的定量分析 定量，覆盖率＞95% 蛋白磷酸化修饰分析 基于LC/MS 修饰位点个数、种类、分布位置统计,覆盖率＞98% PRM靶向定量 PRM 二标包 高通量数据分析及文库构建 原核转录组测序及分析 二代原核转录组测序（BGISEQ平台） 1Gb数据量、2G数据量 细菌、真菌扩增子测序及分析 细菌16S扩增子测序（Illumina HiSeq 2500平台）：V4,V3-V4,V4-V5等；真菌ITS扩增子测序（Illumina HiSeq 2500平台）：ITS1或ITS2 100000tags 细菌16S全长扩增子测序及分析 三代16S全长扩增子测序（PacBio SequelⅡ平台） 6000 reads 细菌基因组完成图测序及分析 三代（PacBio SequelⅡ （或Nanopore）平台）+二代（BGISEQ平台）细菌基因组从头测序组装（完成图） 不少于细菌基因组150X 细菌基因组重测序及分析 二代细菌基因组重测序（BGISEQ平台） 1Gb数据量 宏基因组测序及分析 二代（BGISEQ平台）宏基因组测序 10Gb数据量 宏病毒（宏转录）测序 基于Illumina平台及PacBio平台 10 G 酵母cDNA文库构建 基于gateway和smart体系进行建库 平均插入片段＞1200bp；文库原始库容量＞1*10^7CFU；文库空载率＜5%。 真核转录组测序及数据分析 真核转录组测序及数据分析 不低于8 G的clean data，并完成有参考基因组的相应质控（数据质量Q30 > 85%）及分析，包含数据的过滤及与参考基因组比对、表达量分析、样品间PCA分析、样品间皮尔森相关性分析、差异基因分析、基因注释、样品间基因韦恩图分析、Kegg分析等信息分析。 烟草基因组与注释 烟草基因组与注释
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