5月直播课：叶绿体基因组分析与发文突破

作者：王韵壹、李英、熊慧卿

叶绿体基因组结构和序列的信息在揭示物种起源、进化演变及其不同物种之间的亲缘关系等方面具有重要价值。随着测序成本不断降低，用叶绿体基因组数据发表相关SCI论文具有较高性价比。那么，如何将叶绿体基因组的数据分析出彩，讲好一个完整而有意义的故事，从而实现文章档次的突破呢？为此我们科研日精进课堂请来了“牛人”，将在 5月带来精彩大课-- 《叶绿体基因组分析与发文突破》。5天课程，掌握叶绿体基因组数据的组装、注释、比较分析和构建系统树，同时讲师将无保留分享自己如何用叶绿体基因组数据发1区和2区文章的经验。

主办平台

科研日精进课堂

授课形式

5天直播课+永久答疑+无限回放

开课时间

每天 19:30-21:00，课前半小时答疑

永久答疑，0基础可掌握

提供高性能服务器配合练习

赠送Linux和R语言基础课程

叶绿体基因组完整分析流程和发文思路

课程插图

课程安排

向上滑动查看课程表

第1天浅层基因组数据评估及过滤

1. fastqc使用

2. fastp使用

第2天叶绿体基因组组装及组装后的校正

1. Novoplasty

2. Getorganelle

3. Pilon

第3天叶绿体基因组注释及上传

1. Plann软件

2. OGRDROW网站

3. CPGAWAS网站

第4天叶绿体基因组比较分析

各分区边界比较（IRScope）

2. 叶绿体基因组全局比较（mVISTA）及线性区块比较（Mauve）

3. 查找高变区（DnaSP v.5）

4. 重复序列鉴定包括SSR及散在重复序列（Tandem Repeat Finder、REPuter）

第5天基于基因组构建系统树及发文指导

1. 叶绿体基因组CDS提取（Phylosuite）

2. 最大似然树（Iqtree）、贝叶斯树（Mrbayes）构建

3. 发表文章思路解读（低分文章速发版+高分文章套路版）

课程介绍

平台

"科研日精进课堂"是一个广大科研人员学习提高生物信息分析能力，获取最新生信技巧和资讯的活跃平台。

讲师

孟老师科研日精进课堂高级讲师

副研究员，精通Linux、R语言和高通量数据分析（转录组、叶绿体基因组、重测序）。作为主要参与人负责多项国家基金，省级基金的申报与结题工作，以第一作者或通讯作者发表SCI论文5篇，其中JCR 1区1篇，2区1篇（通讯作者）。

学习

1. PC 端：学员可以在PC端进行学习，方法是在网站"www.keyandaydayup.com"中点击视频课。

2. 微信端：在公众号“科研日精进课堂”点击视频课-直播课。

3. 课程在两年内均可以无限次回放。

答疑

1. 答疑期间，学员可以共享自己的屏幕并语音互动，讲师帮助解决学员遇到的问题。

2. 课程结束，学员可以继续在答疑群提问，获得终生答疑。我们坚持，报名一次，服务终身，保证让您掌握所有的知识。

缴费

1. 推荐直接线上购买课程；

2. 若需对公转账，可先拍下课程，然后课程助理会与您沟通，我们会在单位转账完成后退还费用。

发票

可提供培训、会议通知或合同等，发票可开会议注册费、测试分析费等内容。

培训费用

2200元/人

拼团优惠300元，3人成团，5月15日前报名再优惠100元，优惠券直接在报名页面领取。另赠送R和linux预习课程，请尽量早报名哦！

报名方式

2. 收到报名信息，我们会电话或微信与您沟通

3. 课程助理会根据您要求提供合同、会议通知（邀请函）、发票等，发票明细可开培训费、会议费、技术服务费、测序分析费等。