D轮融资3000万,基因AI公司Sophia Genetics凭什么入选2017年最聪明...



  这是一家总部位于瑞士洛桑的的生物医药公司,成立于2011年,主营业务是帮助医疗机构建立基因分析系统,协助其利用机器学习技术分析患者基因数据,给出诊疗建议。2017年9月该公司拿到欧洲知名风投机构Balderton的3000万美元的D轮融资。

  过去两年里AI和基因热度不减,这两个领域似乎在世界范围内都不是新鲜事,为何唯独选择了Sophia Genetics?

  智能,平台与隐私

  智能

  当我们对给定样本测序完毕后,基因测序诊断分析一般要经过三个步骤:

  序列比对(Alignment)―变体识别(Variant Calling)―诊断预测(predictions)。

  每一个部分都有对应的通用算法。但是由于基因种类太多,这些通用算法的效果并不让人十分满意。

  Sophia Genetics于是抓住了这个痛点,研制出了三款以人工智能为基础的基因分析专利技术:PEPPER, MUSKAT 和 MOKA,分别是为了识别单核苷酸多态性变异与删除(SNP and INDEL),识别拷贝变异数(CNV)以及对基因的变异进行严重性的评估。

  (编者注:单核苷酸多态性变异,碱基的删除,拷贝变异都是基因突变的种类。分析基因,很大程度上就是在找到这些突变基因,并且评估他们会带来的潜在危险。)

  由于笔者未能在网上找到其专利数据,因此不能做出进一步分析,但是根据官网显示,这些技术能够实现99%以上的准确率。

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  Sophia Genetics的联合创始人之一,现任CEO Jurgi Camblong博士在一次采访中谈到,智能算法作为企业的核心技术,他们投入了大量精力进行研发。

  为了得到适用范围更广的算法,他们花费几年时间组织专家一起标注了来自10000名患者的近50000条基因信息,从最底层开始设计算法,以求完全理解每一个细节。

  功夫没有白费,Sohpia公司智能算法对基因变体的分类准确率由原来的85%上升到99%。

  Jurgi 面对媒体采访时,表示“正是这种一步步从底层开始建立模型,融合专业知识,力求了解每一个细节的技术坚持,让他们和领域内其他的公司区分开来。”

  投资方Balderton的合伙人James Wise也对媒体表示,Sophia Genetics 最吸引他们的一点在于,他们的算法能够处理来自各种不同测序仪的基因数据,并且给出的预测已经达到可供临床使用的准确率。

  目前,Sophia Genetics主打肿瘤,遗传性癌症,心血管疾病,代谢疾病,儿科疾病五大门类的基因辅助诊断与智能预测。

  平台

  如果说对技术的执着是Sophia Genetics能够脱颖而出的底气与资本,准确把握医院需求,建立共享平台则是其对未来的憧憬与投资。

  Sophia DDM是公司推出的一款平台。DDM代表 Data-Driven for Medicine (以数据驱动医疗),反映了公司的愿景。

  上述提到的智能算法,都包含在这款平台上。Sophia Genetics瞄准的是B端的医疗机构,其核心业务就是通过帮助那些有测序条件的医疗机构,接入SophiaDDM平台,从而使得医务工作人员能够快速准确得对基因进行分析。

  在医生上传基因数据的同时,其实也同时贡献了一条新的基因数据,并且很有可能会给出自己的诊断结果。

  这样一来,随着使用DDM平台进行分析的人数越来越多,后台积累的标注过的数据也越多,底层的智能算法,得益于高质量的数据,表现也会越来越好,由此形成了一个良性循环。

  当被问到为何要如此坚定的推进平台,提供软件服务,Camblong 表示,随着测序成本的不断下降,人们获取自己的基因信息也变得越发容易,这也就意味着市场上必然会有大量的对于快速、准确的基因分析算法的需求。

  好的基因分析算法离不开专业知识和优质的数据。因此,如果能够与医院建立良好的联系,帮助医院建立系统,去分析患者的基因数据,这样一方面得到了患者的数据,另外一方面还能够利用医生的专业知识对基因进行标注。

  平台连接的医院越多,储存的基因数据,凝结的专业知识也越多,由此训练出的算法更加智能,能够吸引的医院也更多。这是一个自激过程。

  当然,Camblong 坦言,这个过程并不轻松。




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