第五期 应用网络药理学和生物信息学技术研究中药复方或单体的学习班



玮瑜独家主办 2017年11月11日-12日(周六日) 北京

授课讲师寄语:

作为国内首个“应用网络药理学和生物信息学技术方法研究中药复方/单体学习班”的主创讲师,已与上海玮瑜合作在上海和北京连续举办了四期“应用网络药理学和生物信息学技术方法研究中药复方/单体的学习班”。由于课程是本人自主设计和编排的,属于国内首创,以其信息量大、专业性强、操作性强的特点,一经设计和推出,就深受广大学员好评,过去的四期学习班场场爆满,学员听完后更是直呼过瘾。当然深受欢迎的同时也吸引了其他同行的模仿和抄袭,这也是对我本人的一种肯定和鼓舞,激励着我去不断调整和优化课程内容。经过内部讨论,我们决定在今年的“双十一”推出“网络药理学2.0”课程,为了更好的设计和组织课程内容,我们特地腾出了近50天的时间来筹备这场“双十一”的学术盛宴,而这也将是我们今年在北京开设的最后一场学习班,欢迎广大老师同学前来参加,我们共同探讨,共同学习。

课程简介:

中药复方以及中药单体配伍制剂是现代中医治疗疾病的主要方式,它通过潜在的成分-靶点相互作用来治疗各种疾病,在降低不良反应的同时最大化治疗效果。然而,由于中药的成份多、作用机制复杂的特点造成了中药作用机理的不明确,研究难度大,尤其是在SCI论文发表过程中无法获得认可和支撑。

近年来,随着网络药理学和生物信息学的发展,将生物信息学技术和网络药理学方法相糅合,联合实验验证成为中药复方机制研究中的重要方式之一,在SCI论文发表方面获得了新的进展。基于该模式的中药复方研究打破了传统的中药复方机制研究的瓶颈,使得原先难以定性的机制得以预测和验证。该研究方法适用于各类病症的中药复方/单体治疗机制研究,现已成功应用于多篇SCI(IF>5)论文的发表。

与此同时,中药单体和复方的研究成为近年来研究的热点和国自然基金重点扶持的领域,作为临床医生、科研人员和硕博士研究生,尤其是没有生物信息学分析基础和网络药理学基础的初学者,在面对错综复杂的数据时,难免会无从下手,遇到一个小小的技术难点总会卡住很久,研究进度十分缓慢。比如下面这些问题:

(1)如何去筛选中药复方的有效成分和预测作用靶点?具体如何操作,如何实现,有无高效可行的方案?

(2)如何去挖掘成分-靶点、靶点-疾病、靶点-信号通路之间的关系?并绘制网络关系图?

(3)如何通过多种方式去预测中药单体成分作用的靶点,并进行机制研究?

(4)如何利用生物信息学数据库将基因表达谱数据和药物机制关联在一起?

(5)如何利用生物信息学的方式解析中药复方/单体的作用机制,把疾病-药物-机制三者关联在一起?

(6)如何利用GEO等数据库,在没有R语言基础的情况下也能实现芯片分析和处理,挖掘免费可得的数据,为自己的中药复方研究和基金申请增添亮点?

(5)如何利用多种富集分析的技术和方法,为自己的机制研究提供方向指引,为文章发表和基金申请绘制高质量的富集分析图片?

(6)如何利用网络药理学和生物信息学的方式,通过大数据挖掘和整合分析,为自己的国自然基金添砖加瓦,充实自身的前期研究基础,讲好属于你的故事?

本次学习班将带领广大学员,共同学习将网络药理学和生物信息学相结合的中药复方研究思路,突破中药复方SCI文章的5分魔咒,同时讲述如何将网络药理学和生物信息学分析应用于国自然基因的申请。现场操作教学,带领学员解析中药复方作用机制,学员也可以将自己研究的复方带来学习班,利用课间时间解析中药复方作用机制。

课程内容、目标与特色:

本次学习班课程严格按照中药复方解析的顺序设计,层层递进,逐步挖掘中药复方的作用机制。将讲述如何利用VBA工具检索复方成分并使用ADME参数筛选有效成分;如何利用VBA工具检索成分靶点;同时也会讲述如何使用药效团模型靶点预测工具开展中药单体成分的机制研究;如何使用Cytoscape构建成分-靶点网络和进行网络拓扑分析,以及多种插件的灵活使用;如何利用Cytoscape构建多数据库来源的蛋白质相互作用网络;如何利用拓扑分析算法筛选网络核心靶点;讲述如何将GEO数据库和Connectivity Map数据库相关联,应用于中药复方的机制研究;如何利用简单在线工具进行富集分析,以及绘制富集散点图、文恩图等。




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