独家对话智峪生科新“舵手”王晟博士:基于A



独家对话智峪生科新“舵手”王晟博士:基于A

近日,智峪生科宣布新的人事任命:宣布全球蛋白质结构预测翘楚王晟博士正式加入公司担任智峪生科 CEO,负责蛋白质计算业务与公司整体战略规划。王晟博士精耕蛋白质结构预测及计算十多年,曾在全球最富盛名的 CASP 及 CAMEO 比赛中名列前茅,是该领域的顶级专家。

智峪生科团队表示," 王晟博士的加入,将成为推动公司发展的重要里程碑时刻。在持续精进公司蛋白结构预测及设计业务的同时,王晟博士的加入将开启智峪生科基于现有技术拓展合成生物学边界的道路,从而‘为蛋白质结构领域带来一场看得见的革命’。"

智峪生科成立于 2021 年 4 月,目前已自主打造了完整蛋白质结构预测、设计、生产体系,提供药物辅助研发与合成生物学两大类服务。成立不到一年,公司便连续获得了由鼎晖投资和朗煜投资领投的天使轮和由高瓴创投领投的 Pre-A 轮融资,累计融资金额过亿元。

独家对话智峪生科新“舵手”王晟博士:基于A

智峪生科 CEO 王晟博士

作为人工智能结合蛋白质研究领域全球顶级学者、腾讯 AI Lab 前高级研究专家,王晟博士的加入,将为智峪生科加固哪些方面的已有优势以及注入哪些新的发展基因?智峪生科团队当前又在畅想一场怎样的 " 巴西vs瑞士让球 领域的革命 "?动脉网与智峪生科 CEO 王晟博士进行了独家对话,望揭开以上问题的答案。

以下为动脉网与王晟博士之间的部分对话实录:

(为便于读者顺畅阅读,动脉网在文字上做了不改变原意的编辑)

  蛋白预测、蛋白设计:

巴西vs瑞士让球 下一次爆发的关键所在

动脉网:智峪生科可以说是诞生在去年蛋白质结果预测和设计的火热浪潮下。当初智峪生科的创建,主要是瞄准了国内行业的什么痛点?

王晟博士:智峪生科在成立之初主要瞄准了两个市场痛点:蛋白质结构预测以及蛋白质结构设计。在发生 Alphafold2 对于蛋白质结构高精度预测的突破之后,团队几位创始人一致认为,该突破一定会为蛋白质结构设计领域带来重大影响。而蛋白质结构设计相比蛋白质结构预测会对生物医药领域,尤其是合成生物学领域带来更加广泛而深远的影响。

蛋白质结构预测打通了从一维到三维的路径,我们认为,蛋白质结构设计这条从三维到一维的路径理论上也是可以被打通的。蛋白预测、蛋白设计这一互为逆问题的硬币两面,是巴西vs瑞士让球 下一次爆发的关键所在,将会为合成生物学领域带来革命性的突破。

动脉网:能否具体谈谈这种革命性的突破主要表现在哪些方面?对于新药研发领域、合成生物学领域各有怎样的影响?

王晟博士:在蛋白预测方面,Alphafold2 的突破,解决了从一维到三维的蛋白质结构高精度预测问题,令科学界亟待攻坚的方向转为了如何根据功能要求确定三维结构,从而设计出相应蛋白序列。Alphafold2 的突破对于新药研发领域的影响,在于对复杂蛋白质结构获取难度的降低。直接利用蛋白质序列进行蛋白质结构的获取,这在过去是很难想象的。Alphafold2 预测的蛋白质结构可以促进基于结构的药物设计,特别是对于那些缺乏足够的蛋白结构信息的新靶点。

对于合成生物学领域而言,Alphafold2 的突破的意义会更大。去年 7 月,DeepMind 在《Nature》发表了文章,描述了 AlphaFold 对人类蛋白质组的结构预测,覆盖了 98.5% 的所有人类蛋白质组,并且 AlphaFold 能够对人类蛋白质组 35.7% 氨基酸结构位置进行预测……这对于合成生物学领域而言是一个非常重要的突破。众所周知,酶是生物合成反应里一个非常重要的催化元件,它是一种蛋白质。此前,我们能够获取酶的基因序列信息,但很难通过实验的方式将大多数酶的结构预测出来。现在,利用高精度高通量蛋白质结构预测技术,我们可以快速、准确地了解到关于酶的三维结构信息,从而挖掘出那些潜在的具有非常重要工业价值的酶。

蛋白质结构设计对合成生物学领域的影响更为广泛而深远。蛋白设计意味着我们可以设计、合成满足功能需求的酶,甚至这种酶在自然界从来不存在过。目前,产业界有很多的高价值小分子,利用传统化学合成的方法来合成可能会存在高污染、高能耗甚至低效率的问题。但是又找不到一种很好的生物合成途径将它合成,或许就是因为缺乏某一种关键的酶。




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