解析新冠病毒Nsp15蛋白结构,SARS药物或可用于新



自农历新年以来,《新闻联播》几乎所有的新闻条目都会频繁地播报“新冠肺炎”和“新冠病毒”的字眼。新型冠状病毒从中国大陆中心-武汉出发,一个多月的时间就席卷了全世界46个国家。国际社会对这次新冠肺炎表现出空前的关注,世界卫生组织(WHO)2月派遣专家组来华进行了针对新冠肺炎的考察。

21世纪第三个新年代的开端年2020,互联网的发展和自媒体的兴起使得关于新冠肺炎真真假假的信息传播地比病毒本身要快很多。对比与此次病毒结构非常类似的非典(SARS)病毒肆虐中国的时期,全世界的普通民众对新冠病毒(SARS-CoV-2)的了解可谓是全方面的,也因此减少了很多不必要的恐慌。

面对肆虐的疫情,来自全世界的科学家都在积极地进行针对新冠病毒的新药研制。1月31日新英格兰医学杂志发表了一篇论文,报道了第一种有效的药物,即吉利德(Gilead)公司研发的原本用来治疗埃博拉(Ebola)病毒的瑞德西韦(Remdesivir)。

这篇文章一上线,就引来了广泛的关注,在网络上此药甚至曾一度被誉为“人民的希望”。后又爆出用于治疗HIV的药物也是有效的。2月17日下午的国务院联防联控机制新闻发布会上,科技部生物中心推出了首款国内官方 “新药” ,即治疟老药磷酸氯喹,称基于临床研究看到了其对新冠肺炎的疗效。

在全球传播和影响风险级别被上调至“非常高”之际,疫情在中国得到了非常有效的遏制,国内除病毒高发地区外的一大部分城市纷纷将传播危险等级下调。3月除,很多公共服务部门和企业已经复工复产。

虽然情况好转,治疗新冠肺炎的“特效药”依然尘埃未定,针对新冠病毒的新药研发如火如荼。

3月2日,美国芝加哥大学阿贡国家实验室西北大学Feinberg医学院和加州大学河滨分校医学院的团队合作,在预印本网站 BioRxiv 发表论文:Crystal structure of Nsp15 endoribonuclease NendoU from SARS-CoV-2。

该研究解析了新冠病毒中一个可作为药物研究靶向蛋白质Nsp15的晶体结构。研究结果显示,之前用于治疗SARS的药物能够被研发用于治疗新冠肺炎

解析新冠病毒Nsp15蛋白结构,SARS药物或可用于新

解析新冠病毒Nsp15蛋白结构,SARS药物或可用于新

图1. 新冠病毒药物靶向蛋白Nsp15的晶体结构

新冠病毒中Nsp15的结构与SARS病毒中蛋白质的结构相似程度高达89%。2010年有关SARS病毒的研究表明,抑制Nsp15的表达可以减慢病毒复制。因此研究团队指出,之前任何靶向Nsp15的药物都有可能成为治疗新冠肺炎的特效药。

蛋白质含有大量精确的折叠结构,其活性位点可以被用作化学物质作用的靶点。解蛋白质结构对于新药研发和疾病治疗有着重要的意义。近些年,清华大学医学院在这方面也有很多重要的研究进展。解蛋白质结构的第一步是克隆蛋白并培养蛋白质单晶。想要看到蛋白质单晶中每个原子的排列方式,需要一个古老而有效的技术--X射线。在此次联合研究中,阿贡国家实验室的先进光子源(APS)提供了超强的X射线和X射线晶体学支持。

此次报道Nsp15结构的团队同属于一个总部设在西北大学的国际合作中心:Center for Structural Genomics of Infectious Diseases。中心自新冠病毒爆发以来就开始了相关研究。新冠病毒其他28个蛋白质的结构或将在不久的将来被解出来。

3月4日,RSCB蛋白质数据库()将会发表Nsp15的结构。

论文链接:

https://doi.org/10.1101/2020.03.02.968388

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