福建农林大学参与破译“香料皇后”基因密码

作者：杨超月

　　中国教育新闻网讯（记者龙超凡通讯员曹佳奕）继破译小菜蛾基因组、在全世界第一次公布世界性鳞翅目害虫的基因组之后，福建农林大学近日在植物基因组破译方面也取得重大突破：该校与国家兰科植物种质资源保护中心(深圳）联合完成了深圳香荚兰基因组测序工作。这意味着“香料皇后”香荚兰基因组被成功破译。

　　据了解，兰科植物占全世界植物种类10％，是世界性的濒危物种，也是国际贸易公约保护物种的重中之重。香荚兰为兰科香荚兰属植物，又名香子兰、香草兰、香草、香兰，被誉为“香料皇后”，是典型的热带雨林中的一种大型兰科香料植物。

　　由于全球尚未有对香荚兰进行基因组测序及分析的成功案例，而其所在的香荚兰亚科在基因组测序上也仍处于空白状态，2014年7月，福建农林大学联合国家兰科植物种质资源保护中心(深圳）正式启动“香荚兰基因组项目”，该研究率先对深圳香荚兰进行全基因组测序和生物信息分析，同时对相关种类的转录组进行测序和分析。

　　福建农林大学校长兰思仁教授介绍，深圳香荚兰基因组测序采用全基因组鸟枪法测序（WGS）策略，使用IlluminaHiseq2500测序平台进行测序。目前已经获得260Gb测序数据，基因组大小约800Mb，测序深度为325X，组装结果接近精细图标准，其中ScaffoldN50=288Kb，ContigN50=22Kb，基因数量约29000个，杂合度约1.14%，属于高杂合复杂基因组。

　　兰思仁表示，香荚兰基因组被成功破译，将使得香荚兰成为第一个完成测序的兰科藤本植物，将获得第一个重要香料植物的基因组图谱，为揭示兰科植物起源和系统演化研究奠定重要基础，为香荚兰保育研究工作和产业化提供新的突破口，有利于推进香荚兰乃至所有兰科植物相关产业链的发展。