基因测序证实猴痘已大规模社区传播，多国卫生官员为6月拉响警报

作者：杨超月

　　随着法国、意大利、西班牙在内的多个欧洲国家研究团队发布新一轮猴痘病毒基因测序报告，越来越多的证据显示，猴痘已经在欧洲发生了大规模的社区传播。

　　由于目前已知猴痘病例主要出现在男性行为者中，在六月即将到来之际，全球卫生官员提醒相关群体，应随时对猴痘病症保持高度警惕。

　　猴痘是一种由猴痘病毒(MPXV)引起的人畜共患病，被认为是自天花根除以来人类最重要的正痘病毒传染病。猴痘病毒能够通过病变体、体液、呼吸道飞沫和污染物质从人传播到人，但人人传播通常需要长时间密切接触。猴痘的致死率约为1%-10%，儿童的死亡比例最高。在本轮疫情暴发前，猴痘病例主要在非洲中部和西部地区热带雨林散发，非洲之外的病例都被认为与非洲旅行有关。

　　本轮猴痘疫情在全球蔓延速度之快，传播路径之不寻常，实属罕见。世界卫生组织已证实，自5月初英国发现第一起猴痘病患以来，目前在全球大约20个国家发现了300多例猴痘确诊病例及疑似病例。大部分病例是在男性之间发生过性关系的男性。有分析认为欧洲此前两场狂欢派对中大规模性行为或是本轮猴痘蔓延的主要原因。

　　在欧洲，科学家们对最新猴痘病毒基因组的测序仍然在紧张进行中。这为跟踪当前疫情中病毒的传播提供了更明晰的分辨率。

　　截至本文发稿时，来自法国、意大利、西班牙、荷兰、比利时最新9份猴痘病毒基因测序报告相继公布，研究者们表示，已有的猴痘病毒基因组序列的分析显示，病毒都属于温和的西非分支，病毒样本之间的关系极为紧密，进一步确证了猴痘在欧洲已经出现了大规模的社区传播。

　　此前，葡萄牙国家卫生研究所的约翰.保罗.戈麦斯（João Paulo Gomes）及其同事已公布了10份葡萄牙猴痘患者携带的猴痘病毒基因组测序报告，并分析指出，本轮猴痘疫情爆发极有可能来自一个源头。

　　当地时间5月27日，意大利研究团队公布了第一份意大利猴痘患者的病毒样本基因组测序报告。该33岁男子5月18日由葡萄牙抵达意大利, 因肛周溃疡、双边腹股沟淋巴结肿大、双肘部、背部、臀部和左脚少量丘疹和水泡性皮肤病变前往当地医院就诊，出现皮损前几天，患者发热(38.5°C)持续一天，伴有咽痛和打喷嚏。研究团队对该病例携带的病毒样本基因组测序使用了Illumina平台，测序深度为19倍。分析结果显示，该患者携带的猴痘病毒基因组属于西非进化支，与葡萄牙团队上传的基因组样本关系极为密切。

　　同一天，西班牙团队公布了西班牙第一份猴痘病毒样本基因组测序报告。基因组草图的覆盖率为98.6%，平均测序深度为77倍。该病毒基因组同属猴痘病毒西非进化支，与关系最密切的葡萄牙一支序列相比，单核苷酸多样性位点(SNPs)小于4个，与德国序列相比，单核苷酸多样性位点(SNPs)为2个。

　　荷兰的研究团队在此前一天，公布了首份荷兰猴痘病毒样本基因组序列报告，团队使用了Nanopore基因测序平台，测序深度为10倍。研究者在报告中称，病毒在进化树上与此前葡萄牙团队公布的基因组样本极为相似，与关系最为密切的一份葡萄牙样本相比，只出现了2个单核苷酸多样性位点(SNP s) 。

　　此外，来自法国的第一份病毒基因组序列，比利时的第二份病毒基因组序列都表现出了与葡萄牙最早公布的基因序列极高的相似度，且都属于病毒基因进化树上的西非分支。

　　意大利研究团队进一步表示，“目前的基因组测序结果进一步支持了这样的结论，即猴痘病毒在欧洲已经发生了大规模的社区传播。”

　　此外仍然值得高度关注的是，在北京时间5月28日晚间，法国研究团队公布了最新一个法国患者携带的猴痘病毒基因组全序列测序报告，四份基因样本通过Illumina测序平台，测序深度达到了950倍——这也是目前为止深度最大的测序(测序深度越深，测量越准确) 。结果显示，相较于2018年在英国发现的猴痘病毒基因，这四份病毒基因样本出现了46个单核苷酸多态性位点((SNPs)和3个缺失。

　　此前，英国爱丁堡大学的演化生物学家安德鲁·兰博特（AndrewRambaut）表示,“我们曾估计天花病毒（猴痘的近缘病毒，同属正痘病毒属）的基因组每年每个位点大约有1x10-5个替换，从而造成病毒平均每年1-2个核苷酸变化。这是估计的高端。”研究者们表示，猴痘病毒的核苷酸变异率显然超乎人的预期。

　　全球卫生官员呼吁性少数群体应高度警惕