肿瘤微环境如何发高分?这篇另辟蹊径的炎症+



肿瘤微环境如何发高分?这篇另辟蹊径的炎症+Treg 10分文章你不得不看!

2022-03-11 09:28 来源: 小张聊科研

原标题:肿瘤微环境如何发高分?这篇另辟蹊径的炎症+Treg 10分文章你不得不看!

撰写: 肥硕 来源:小张聊科研平台的“科研讲坛”公众号,微信公众号搜索“科研讲坛”即可关注/扫描关注见文末

调节性T细胞(Treg)维持免疫稳态,环境驱动对Treg细胞向效应Treg(eTreg)分化至关重要。然而,炎症环境中人Treg细胞的功能特征尚不清楚。来自荷兰乌得勒支大学Femke van Wijk教授课题组的研究首次发现,炎症环境在表观遗传水平通过增强子上调特异性eTreg基因的表达,并鉴定出VDR参与Treg细胞分化且存在正反馈效应。此外,炎症环境中Treg细胞与肿瘤浸润性Treg细胞有诸多相似表型。相关研究结果于2021年5月发表在Nature Communications(IF: 14.919)上。

一、背景介绍

越来越多来自小鼠模型的证据表明,特定的环境,如炎症或非淋巴组织,可以诱导Treg细胞进一步分化/适应为特殊激活的Treg细胞亚群(eTreg)。eTreg细胞的特征似乎是维持FOXP3的表达,与其功能相关的一些分子的表达增加,如ICOS、CTLA4和TIGIT,以及对局部环境的适应

在小鼠中,eTreg细胞已被证明在特定的炎症环境中至关重要。炎症信号可以诱导典型的Th细胞转录因子T-bet的稳定上调,使Treg细胞迁移到炎症部位。此外,T-bet和Foxp3的共同表达对于预防严重的Th1自身免疫至关重要。为了利用Treg细胞治疗人类疾病,迫切需要解释炎症环境中人eTreg细胞的编程。

在人类中,也有证据表明环境诱导了人eTreg细胞的适应,包括肿瘤浸润性Treg细胞。炎症环境中,人eTreg细胞编程的多样性稳定性是否受到表观遗传调控,仍待解决

文章思路图

二、结果解析

1、Treg细胞的核心特征在关节炎症中增强【差异基因分析】

为了研究人Treg细胞在炎症环境的表达谱差异,作者从青少年特发性关节炎(JIA)患者的滑膜渗出液、外周血以及健康儿童或成人的外周血中分离出Treg细胞和non-Treg细胞。RNA-seq+主成分分析(PCA)示,滑液来源Treg(SF Treg)与外周来源Treg(PB Treg)明显分群(Figure 1a)。体外抑制实验示,SF Treg可抑制PBMC的增殖(Figure 1b)。GSEA示,相较于SF non-Treg细胞,SF Treg细胞特异性富集Treg细胞特征性基因如,Foxp3,CTLA-4,TIGIT(Figure 1c-d)。PCR示,SF non-Treg细胞略微上调Foxp3,CTLA-4,TIGIT的表达,这是T细胞活化的标志(Figure 1d),并得到了流式细胞在蛋白水平的验证(Figure 1e)。

综上,炎症环境上调了Treg细胞效应功能相关基因的表达,增强了Treg细胞的功能。

图1

2、炎症来源的Treg细胞具有特征性效应谱【分化方向鉴定】

对SF JIA Treg和PB child Treg配对比较示,Treg细胞核心标志物如,Foxp3和CTLA-4以及Treg细胞分化标志物如,PRDM1, ICOS,BATF和BACH2的表达存在显著差异(Figure 2a)。分层聚类分析eTreg细胞分化相关标志物示,Treg核心基因如CTLA4,FOXP3等在所有Treg细胞群中表达上调(Figure 2b,Box1)。且Treg细胞特异性表达GMZB,ICOS和IL10(Figure 2b,Box2)。其中,一些基因如,CD40LG,BACH2等在SF Treg中显著低表达(Figure 2b,Box2-3)。此外,Box2与Box3之间的差异表达基因与eTreg细胞谱相关,并得到了流式细胞在蛋白水平的验证(Figure 2c)。GSEA还在SF Treg细胞中富集到在eTreg细胞中显著差异表达的基因(Figure 2d)。

综上,自身免疫环境诱导人Treg细胞向eTreg细胞特征分化。

图2

3、SF Treg细胞适应干扰素富集的环境【特征基因鉴定】




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