最新研究丨新冠病毒快速抗原检测对奥密克戎等



最新研究丨新冠病毒快速抗原检测对奥密克戎等变异株的敏感性如何?

2022-03-13 22:56 来源: 武哥说生活

原标题:最新研究丨新冠病毒快速抗原检测对奥密克戎等变异株的敏感性如何?

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核心提炼

OraSure InteliSwab ® Covid-19快速抗原检测获得 FDA 紧急使用授权,它可以快速诊断新冠感染且不降低新冠病毒原始毒株、包括奥密克戎在内的任何关注变异株(VOC)的敏感性。

基于叙利亚仓鼠新冠模型,当CT值小于等于25时,100%检测阳性。然而,当CT值大于27时,敏感性极低。

快速抗原检测阳性率受发病时间影响显著。在症状出现后1-2天即可检出,3天左右达到检测峰值,3天后开始检出率降低。当7-10天后,几乎检测不到。

OraSure InteliSwab®新冠病毒快速抗原检测对奥密克戎等变异株的敏感性如何?

译者:陈菲 六安市人民医院

审核:肺克不克肺,蓝鱼

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引言

自新冠病毒(SARS-CoV-2)出现以来,已经开发出了各种各样的诊断方法。这些检测方法主要使用实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCRs)来检测病毒RNA。qRT-PCRs具有较高的灵敏度和特异性,是COVID-19诊断的金标准。然而,qRT-PCRs的诊断需要先进的实验室基础设施和训练有素的人员。而且获得检测结果的时间相对较长,这可能会妨碍直接决策。

另一种诊断方法是快速抗原检测试验(RDT)。RDTs可以在家里完成,在较短的时间内得到结果,是qRT-PCRs诊断的补充。顾名思义,RDT是基于对抗原存在的检测。新出现的关注变异株 (VOC) 凸显了持续验证当前诊断检测方法的必要性。

OraSure InteliSwa b®Covid-19快速抗原检测是最近研发并获得FDA紧急使用授权的快速抗原检测试验(Rapid Antigen-Detecting Test,RDT),它基于一种靶向核衣壳蛋白(NPs)的侧向流动装置。在这里,我们使用所有当前已识别的 VOC(阿尔法、贝塔、伽玛、德尔塔和奥密克戎)与 SARS-CoV-2 的祖先谱系(谱系 A)对比,以评估 InteliSwab 的敏感性。此外,我们采用叙利亚仓鼠 COVID-19 模型来确定 InteliSwab 在受控感染环境中的性能。

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试验的材料和方法

2.1 对新冠病毒变异株的核衣壳蛋白(NPs)进行测定,试剂盒的测试区和对照区各有一条红线表示为检测阳性(如图1a所示)。

2.2 本研究中使用的新冠病毒病毒在VeroE6细胞中进行繁殖,分离的新冠病毒变异株见表S1。

2.3对新冠病毒的检测。在稀释和测试之前,对每个新冠病毒变异株都进行辐照灭活。这种RDT试剂盒对辐照和未辐照的毒株的敏感性都是相同的(图S1)。然后,用1倍的杜尔贝克磷酸盐缓冲盐水(PBS)对辐照后的新冠病毒变异毒株进行10倍连续稀释。每种稀释度进行3次 OraSure InteliSwa b®快速检测,每种变异株总共使用15个试剂盒。通过从10倍稀释液的更精准的检测限值(More precise limits of detection,LOD)开始,对每个变异株进行3次重复的2倍连续稀释,确定了该试验的更精确的LODs。每种稀释液使用三个试剂盒。对10倍连续稀释液,采用相同的程序加载样品和分析测试结果。每个变异株的最终LOD被确定为所有9个测试盒均为阳性的最低浓度。

图S1.德尔塔病毒辐照前后InteliSwab®检测评价

2.4 动物实验。4至6周大的叙利亚金仓鼠(每组6只)接受40µL含1×10e3半数组织培养感染剂量(TCID50)/mL的新冠病毒鼻部挑战。所有病毒悬液均进行全基因组测序,未检测到突刺或核蛋白的SNPs>10%。每天记录重量。在感染后的第1-7天,将口咽拭子收集在 1 mL 的 DMEM2 中。按照使用说明,将 50 µL 培养基移液到 InteliSwab 的吸水垫上,如前所述。

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结果

通过使用单克隆抗体, OraSure InteliSwa b®Covid-19快速抗原检测试剂盒检测到了保守的新冠病毒的核衣壳蛋白 (NP)。为了评估这种RDT对不同变异株的检测性能,我们首先为已鉴定出的新冠病毒变异株和原始病毒株生成重组核衣壳蛋白(表1)。在磷酸盐缓冲盐水 (PBS) 中制备样品稀释液,每个 RDT 使用 50 µL 稀释液。为了确定检测限 (LOD),对每个变体 NP 进行了 20 次测试。在不同的NP之间观察到有限的变化;阿尔法和伽玛的NP LOD为0.313ng/mL,原始病毒株、贝塔、德尔塔和奥密克戎的NP LOD为0.469ng/mL(表2)。

表1. 新冠病毒变异株的核衣壳蛋白突变

表2. InteliSwab®对新冠病毒变异株的检测限值




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