对话全球著名生物信息学家李蔚教授：探针温度计生物信息学将在肿瘤精准医疗中日益凸显其核心价值

作者：杨超月

李蔚教授

美国贝勒医学院终身讲席教授

求臻医学联合创始人、首席科学家

二十年前，面对外资企业的丰厚待遇和科研单位抛出的橄榄枝，李蔚教授选择了后者，一头扎入彼时新兴的生物信息学研究领域。如今，他已成为美国贝勒医学院终身讲席教授（Duncan Endowed Chair Professor）、国际著名的生物信息学专家。截止到目前，李蔚教授共发表学术论文160余篇，其中20篇作为通讯作者发表在国际顶级学术期刊 Nature 、 Cell 及其子刊上，h-index高达64（有64篇论文的引用至少达到了64次）。无论是彼时备受争议的抉择还是如今的学术荣誉载身，皆源于李蔚教授对未知生命领域的探索热情和对科学研究的责任感。

2017年，李蔚教授成为求臻医学的联合创始人和首席科学家。求臻医学致力于以生物信息学和高通量测序技术为手段，为肿瘤患者提供精准医疗及免疫治疗全套解决方案。 近日，测序中国邀请了李蔚教授来分享其学术生涯中鲜为人知的一面以及对肿瘤精准医疗和生物信息学的独到见解。

测序中国：李蔚教授，您本科所学专业为物理专业，是什么机缘促使您走进生物信息学领域，进而成为全球著名的生物信息学家？

李蔚教授： 我一直对探索未知世界和新兴领域有着强烈的兴趣。在大学毕业时，我同时收到了宝洁公司的高薪聘书和中国科学院生物物理所博士研究生的录取通知书，最终我选择了后者。对我来说，发现未知世界奥妙的快乐要远高于外企的高薪。在攻读博士学位期间，我非常幸运的师从中国生物信息学第一人——陈润生院士。作为我国生物信息学研究的先行者，陈老师给予了我很多专业指导和学术启发，让我受益终身。在进行博士研究的同时，我还兼任了华大基因生物信息研究团队的副主管，有幸参与了人类基因组计划，并领导了中国第一个细菌全基因组计划。这段经历也让我更加清晰地意识到生物信息学研究的前沿性和重要性，从而更加坚定地继续从事生物信息学研究。

2004年，我赴美国哈佛大学医学院丹娜法伯癌症研究院从事博士后研究；自2008年起，我在美国贝勒医学院从助理教授开始建立自己的独立实验室，一路做到副教授、正教授和讲席教授。

在过去20年间，我的实验室 在生物信息学算法软件开发、肿瘤表观遗传学和大规模的数据分析方面做了大量原创性的工作 。通过与实验生物学家通力合作、优势互补，我们还从生物信息学的角度去回答了许多肿瘤发展过程中的关键问题。

我们实验室开发的 多个生物信息学软件已经成为当前肿瘤大数据分析的常用软件。 比如我们在2007年开发的MACS算法，目前已成为ChIP-Seq数据分析的标准算法。该论文自发表后已被引用超过5000次。加上我们发表的其他论文，我们工作的 总共引用已超过了3万次， h-index 高达64 。

尽管从某种层面上来讲，我当时选择生物信息学有些机缘巧合，但多年的学术积累让我对生物信息学的研究热情与日俱增，对生物信息学的应用前景也愈发有信心。

测序中国：您曾参与人类基因组计划等重大项目，多年来一直将生物信息学和大数据分析与肿瘤等多种疾病的临床研究相结合。您认为生物信息学对于肿瘤研究的价值体现是什么？

李蔚教授： 完成人类基因组测序是21世纪初科学界最重要的科研成果之一，为我们提供了一本包含人体30亿对碱基的生命天书，这本生命天书是研究肿瘤、心血管等重大疾病的参考蓝本。生物信息学为测定和解读人类基因组这本生命天书起到了至关重要的作用，迅速推动了肿瘤发病机制、驱动突变捕捉、生物标志物探测等研究领域的变革。

从十年前开始，以Illumina为代表的下一代高通量测序技术将传统的生物医学迅速带入到与大数据交叉融合的时代，也将传统的生物信息学推入了一个向现代综合方法发展的快速通道。随着人工智能、未来网络、虚拟现实等新技术的涌现与发展， 生物医学必将彻底变革为一个定量的计算学科 ，使我们对生命的认知更加逻辑化、条理化、精准化。 通过数据的快速收集与汇交，我们将逐渐绘制一幅完整的生命地图。