了解合成多肽的二级结构



多肽一级结构,二级结构鉴定是多肽分析鉴定的关键方法,多肽一级结构有氨基酸组成分析,质谱分析,氨基酸序列分析。二级结构包含:X-衍射,NMR,圆二色谱(CD)等。以下是合成多肽二级结构的分析鉴定和纯度分析。

合成多肽二级结构的分析:

X-衍射

X-衍射可以获得有关化合物晶型的直接信息和相对与构型。

核磁共振(NMR)

二维、三维以及四维NMR伴随分子生物学、计算机处理技术的发展而取得应用,这致使NMR逐步变为大分子结构物质分析的主要方法之一。NMR能够用确定来氨基酸序列、分布以及构象。到现在为止,NMR能够十分精确且快速地取得分析结果,这对分子中不超郭30个氨基酸的小肽的有非常大的分析作用。

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多肽合成核磁共振仪

圆二色谱(CD)

要想获得生物大分子的二级结构,圆二色谱需对蛋白质等生物大分子的圆二色光谱进行测量,其快捷,简单,在酶动力学,蛋白质构象研究,蛋白质折叠等方面获得广泛的使用。是一种特殊的吸收谱。

肽链为圆二色谱紫外区间的主要生色团,这一波长范围的CD谱中含有生物大分子主链构象的数据。在220nm附近无规则卷曲构象的CD谱有一小而宽的正峰,198nm附近有一负峰;α-螺旋构象的CD谱在190nm附近有一正峰,在222nm、208nm处有一负峰。β-折叠构象的CD谱在195-198nm处有一强的正峰,在217-218nm处有一负峰。

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多肽色谱图

纯度分析:

多肽的纯度分析往往都会使用HPLC办法,选取洗脱梯度,5%B--65%B,时长30min,RP-C18,颗粒直径5μm,孔径300A,4.6×150mm,流动相:A,0.1%TFA/H2O;B,0.1%TFA/ACN。有一部分短肽鉴于具有很强的亲水性,在C18上保留比较弱,就需要对条件进行调整,具体的办法有以下两种:

1.在流动相中添加七氟丁酸,十八烷基磺酸钠等强离子对试剂。

2.对分析梯度进行调整,要把起始梯度换成2%,等度或小梯度洗脱。

写到最后:

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