昆工生物信息学方向代绍兴课题组,计划名额增



大家好,我来自昆明理工大学灵长类转化医学研究院,代绍兴。由于学校下达的招生计划名额增加,现在还有调剂名额。
我们目前接受调剂1名生物信息学方向研究生,欢迎大家咨询了解。
我的简历见网址:
我们目前负责生物信息大数据平台建设和运营,感兴趣可以的话,可以通过邮箱联系我 daishaoxing@163.com


另外灵长类转化医学研究院还有若干研究生调剂名额(>30名),欢迎咨询。调剂qq群:724333096。研究院鼓励大家积极联系导师,以便更好地匹配研究兴趣。导师介绍见网页

大家特别注意只能调剂相近学科,或考试科目相近。还有英语单科成绩需要大于50分(或CTE6级),总分国家B区线即可



课题组专注于利用生物信息学和机器学习等工具,整合疾病的多组学数据,来进行疾病的靶点识别和药物发现。以传统中草药和天然产物为出发点,发展了一系列针对多种疾病(传染疾病、癌症、神经退行性疾病等)和衰老的活性化合物预测方法和平台。为了提高药物研发效率,基于机器学习和深度学习以及化学信息学理论,开发了药物智能研发系统(drugpredict)。主要研究方向有:

1)通过整合严重疾病中的多组学数据发掘和鉴定治疗靶标(系统生物学)
2)对治疗靶点及其药物结合口袋进行三维结构分析和可视化(结构生物信息学)
3)筛选和设计能够靶向和调控治疗靶点的先导化合物(药物发现)
4)机器学习和深度学习在转化医学中的运用

生物信息大数据平台介绍
     生物信息大数据平台于2019年6月,在灵长类转化医学研究院统一领导和支持下,通过整合研究院内的生物信息分析人才和计算资源而建设的生物信息学分析平台。平台建立的目的是作为研究院生物信息分析的支撑平台,同时进行灵长类生物大数据的存储、共享和对外展示,有效利用每个研究组产生的基因组数据、转录组数据、影像学数据、行为学数据多组学数据等。平台建设内容主要包括普通转录组数据分析(rna-seq)、单细胞rna-seq、单细胞atac-seq、全基因组重测序分析、蛋白学分析、代谢组学分析、宏基因组、脑影像图像处理、chip-seq、全基因组甲基化数据分析、多组学整合分析等众多分析流程。目前平台建设已初见成果,承担多项任务,需要增加岗位,故面向社会招聘1-2名生物信息分析研究人员,欢迎有意者前来应聘。平台负责人介绍见网页

单位介绍
     省部共建非人灵长类生物医学国家重点实验室(以下简称“国重”)是在昆明理工大学灵长类转化医学研究院和云南中科灵长类生物医学重点实验室的基础上组建,于2021年经国家科技部批准建设运行。“国重”围绕国家发展战略目标,开展以人口健康为导向,以非人灵长类生物医学为核心的重大基础科学问题和复杂疾病机制与治疗的应用基础研究,设置灵长类生殖与发育调控、灵长类干细胞与组织工程、灵长类动物模型与疾病机制研究等三个研究方向,在灵长类基础和应用基础等研究在国际上处于领先水平,持续在国际顶级杂志发表了一系列有重大国际影响的成果。2014年首次实现了基因编辑猴模型(cell,2014;cell stem cell 2014),被麻省理工评论(mit review)评为当年十大科技突破,《nature》评为里程碑式的工作;2015年首次证明了灵长类胚胎干细胞等多能性(cell stem cell,2015),为干细胞再生医学奠定了理论基础;2017年建立了人类rtt综合症等一批猴模型(cell,2017等),解决了一些其它物种(如啮齿类)所不能回答的重要疾病表型和机制问题;2019年突破猴胚胎体外长时间培养20天(science,2019),首次阐述了人胚胎三维条件原肠发育(nature,2020)。首次发现了灵长类胚胎发育的一些重要分子调控机制、及其与啮齿类明显差异的事实,对解析发育生物学和干细胞多能性等前沿基础科学问题,促进人们对灵长类早期着床后平台发育以及出生缺陷和发育障碍机制理解有重要意义。国重现有科研实验面积3000余平米,包括基因工程实验室、遗传学实验室、干细胞实验室、模型分析实验室、灵长类动物实验平台、蛋白平台、先进影像平台和生物信息大数据平台在内功能齐全的实验空间。此外,重点实验室拥有可容纳1000余只灵长类动物的室外动物房和300笼位的室内动物房,所有动物实验设施均通过国际aaalac认证。详细介绍见网页。
 




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