中国科学院、国家计委、科技部2001年10月12日在京联合宣布，中国水稻（籼稻）基因组“工作框架图”和数据库已经完成，并将公布数据，供全球无偿共享。中共中央政治局委员、国务院副总理温家宝代表国务院致信中国科学院，对我国科学家完成这一“具有国际领先水平的重大科技成果”表示祝贺。

温家宝在贺信中说，“我国首次独立完成具有重要意义和经济价值的水稻基因组‘工作框架图’，标志着我国已进入世界基因组研究的前列。这一重大的科技成果，必将极大地推动世界范围内的水稻研究和农业发展。我谨代表国务院向从事这项研究并作出杰出贡献的科学家和工作人员表示热烈的祝贺和崇高的敬意。”温家宝希望科学家们再接再厉，为全面完成水稻基因组“精细图”的绘制，为我国农业科技进步和农业经济发展，为造福人类的生命科学事业作出更大的贡献。

中科院副院长陈竺介绍，水稻全基因组的序列分析，是研究水稻遗传变异、发育与进化的基础，特别是培育高产、优质、美味的优良品种的基础。研究其基因组，有助于了解小麦、玉米等其他禾本科农作物的基因组。承担并完成这一世界级课题的，是中国科学院基因组生物信息学中心暨华大基因研究中心，及其主要合作单位中科院遗传研究所和国家杂交水稻研究中心。这一工作框架图和数据库以袁隆平院士培育的中国杂交水稻父本“籼稻9311”为研究对象，是2000年5月启动的中国杂交水稻基因组和开发计划的第一部分，其“精细图”将在明年完成。

根据组装和数据分析结果，中国水稻（籼稻）基因组“工作框架图”和数据库具有国际领先地位。它的完成，标志着我国已成为世界上第二个具有独立完成大规模全基因组测序和组装分析能力的国家。

据专家介绍，中国“水稻（籼稻）工作框架序列图”与人类、拟南芥等已经测定的基因组序列相比，主要有八大发现：1 估计水稻基因组中基因总数在46022至55615之间，其基因总数几乎是人类基因组基因总数的两倍；2 水稻基因主要通过基因加倍而使“基因家族”的成员数目增加，但每一“成员”的功能比较单一；3 基因头尾差别大，大部分水稻基因的头部与尾部组成不一样，增加了基因发现的难度；4 水稻、拟南芥与人类基因组都有很多不编码蛋白质的“垃圾”序列。水稻的这些“垃圾”序列多位于基因之外，而人类的却在基因之内。正因为如此，水稻基因的平均长度只有4500个碱基，而人类基因的平均长度为72000个碱基；5 拟南芥已发现有2.5万个基因，80％左右的基因在水稻的基因组中都可找到。而水稻基因组中只有一半不到的基因在拟南芥基因组中找到；6 籼稻与粳稻的基因组有1/6不一样；7 水稻序列的相互之间差异近1％，而人类序列的相互差异为1‰左右；8 籼稻与杂交水稻母本的序列给杂交水稻的机制提供了新的启示：“杂交优势”很可能与基因组大小、基因表达等都有关系。