杀入三代测序蓝海 地贫产品能成为贝瑞基因新的



杀入三代测序蓝海 地贫产品能成为贝瑞基因新的


本报(chinatimes.net.cn)记者崔笑天 北京报道

继无创产筛之后,贝瑞基因又成为三代测序领域的“破局者”。

8月24日,贝瑞基因宣布了公司推出三代测序产品——三代地贫,即运用第三代基因测序技术进行地中海贫血携带者筛查。

目前,二代测序是分子诊断领域的主流技术,三代测序尚未大规模临床应用,仅有少数公司进行布局。相比二代测序,其在读长上具有优势,但传统观念认为存在错误率高、成本高等问题。

而这次三代地贫产品的问世,是贝瑞基因在三代测序领域的一次试水,在产品的不断验证的过程中,三代测序的种种局限也在得到解决。贝瑞基因董事长高扬告诉《华夏时报》记者,三代测序与二代测序并非互相取代的关系,在临床市场上,它更多呈现相对互补的状态。“三代测序可以解决很多二代测序做不到的问题,比如一些结构特殊、位置特殊的基因突变,这是很多基因病的成因,而二代测序解决的更多的是染色体病。”

这也意味着,未来三代测序有望向更多应用场景拓展,比如其他罕见病、肿瘤、辅助生殖等。

而聚焦本次的三代地贫产品,或将成为贝瑞基因短期内新的业绩增长点。中国南方是地贫的高发地区,一直以来地贫预防主要由政府主导推动。由于三代地贫产品价格相对传统检测仅高出20%,且准确度、覆盖面有全面提升,贝瑞基因有望在部分省市与政府达成合作。未来,借助其在无创产筛业务的渠道、资源积累,地贫产品有望快速打开市场,实现放量增长。

三代测序破冰

目前,主流三代测序平台分为两大类:一是PacBio,二是ONT纳米孔测序。其中,PacBio平台基于SMRT技术,测序时DNA不需要经过PCR扩增,实现了对每一条DNA分子的单独测序,读长可达30kb-100kb,且具有高准确度、无GC偏好性和单分子分辨率的特点,更适合用于遗传病基因检测。

可以看出,三代测序长读长的特点突出,可达到二代测序的100倍以上。但是,其存在成本高、不准确等问题,限制了它的临床应用。

这些问题正在得到改善。关于准确率,PacBio三代测序错误率在10%-15%之间,但是错误是随机的,可以通过对单条DNA分子的滚环测序实现自我校正,达到高准确性。还可以通过同一条分子的多拷贝并行CCS测序进一步校正。测序40次的时候,校正后的准确度可达99.999%,超过二代测序的99%。

“我们现在单次成像的准确度确实只有近90%,但每次10%的出错概率是随机的。这意味着,可以通过多次测序去校正它,不可能每次都在同一个地方出错。所以校正之后的准确度是非常高的。”贝瑞基因三代测序事业部总监任志林说。

关于成本,三代测序为每100万个碱基0.33-1.00美元,高于二代测序六倍以上。但是可以选择仅针对目标单病区域进行检测来降低成本,地贫就是一个很好的例子。并且,产品一旦在临床进行大规模应用,可以提高通量、降低成本。

任志林表示:“好的东西它应该有一个匹配价值的价格,确实我们现在如果做三代的全基因组测序,绝对成本是二代的4-5倍,意味着可能要几万块钱一个样本。但是我们可以不测全基因组,就测一个基因,这样会节省很多测序成本。同时我们努力在临床上去开发大规模应用,每年可以做几十万、几百万的样本的时候,成本会大大降低,甚至会接近二代测序的成本。”

而在技术发展的背景下,三代测序的成本也将持续下降。据方舟投资(ARK Invest)年初预测,到2025年底,三代测序对整个人类基因组测序的成本将下降到100-200美元,和二代测序几乎实现成本平价。同时,三代测序所带来的营收或将以每年82%的速度增长,从2020年的2.5亿美元增长到2025年的50亿美元左右。

杀入三代测序蓝海 地贫产品能成为贝瑞基因新的


图片来源:Pacific Biosciences三代测序仪

目前,贝瑞基因是三代测序仪厂商Pacific Biosciences国内唯一的临床应用合作伙伴,也是其全球最大的合作伙伴。

地贫防治潜在市场巨大

试水三代测序,地贫绝对是一个绝佳切入点。

地贫即地中海贫血(Thalassemia),属于罕见病之一,中国南方是高发地区,目前临床上尚无经济有效的治疗手段,很多家庭因病致贫、因病返贫。




上一篇:三代基因测序实现临床转化 贝瑞基因地贫检测产品率先落地
下一篇:市妇保院开展单基因病扩展性携带者筛查